BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN22519 (UTR included)
(2590 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1995_C1 2962 0.0
>BF14_1995_C1
Length = 1522
Score = 2962 bits (1494), Expect = 0.0
Identities = 1515/1522 (99%)
Strand = Plus / Plus
Query: 401 atgttctttcgttgaaatattaagttgttacctactaaacattgataaaaacgtgatttt 460
|||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1 atgttccttcgttgaaatattaagttgttacctactaaacattgataaaaacgtgatttt 60
Query: 461 ttatgaaacaagtattatttcatagctccgatgtaagaacatgataaaattttggaaaag 520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 61 ttatgaaacaagtattatttcatagctccgatgtaagaacatgataaaattttggaaaag 120
Query: 521 tgctgctaaaggtaaaacaggatgccctgtacgaccaccagagccgattcaaaatgtcca 580
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 121 tgctgctaaaggtaaaacaggatgccctgtacgaccaccagagccgattcaaaatgtcca 180
Query: 581 atcagaattgttaaacattgagcaaaacatagacatagatgataatgtgtttgaaaaaaa 640
||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 181 atcagaattgttaaacactgagcaaaacatagacatagatgataatgtgtttgaaaaaaa 240
Query: 641 atcatcattgtgtatcagtttgaatgacatcctgtacggaaaagtagcaattaaacactt 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 241 atcatcattgtgtatcagtttgaatgacatcctgtacggaaaagtagcaattaaacactt 300
Query: 701 tataacatacatggaaggtattaatcagcaatgcctcataaaatgctggtttgaattgga 760
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 301 tataacatacatggaaggtattaatcagcaatgcctcataaaatgctggtttgaattgga 360
Query: 761 aaattttaaggtctgtttttacaattctaaagaaaacaatgatgagttccgggcaaaatt 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 361 aaattttaaggtctgtttttacaattctaaagaaaacaatgatgagttccgggcaaaatt 420
Query: 821 aattcacacaagaagtttagataaccattctcatgaaattgattttgagaaaaattctga 880
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 421 aattcacacaagaagtttagataaccattctcatgaaattgattttgagaaaaattctga 480
Query: 881 aagttttacatcacaaatatctaattggagatcaagcattcctaatttgagaaaaactaa 940
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 481 aagttttacatcacaaatatctaattggagatcaagcattcctaatttgagaaaaactaa 540
Query: 941 aagtgaatgttcttcaagttcccctgttgattttaagaatcaagacaattgtaattttat 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 541 aagtgaatgttcttcaagttcccctgttgattttaagaatcaagacaattgtaattttat 600
Query: 1001 aagtgataaaaatgttgatattactgaaaaagcaattagtatatttaaaaaatatgttgc 1060
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 601 aagtgataaaaatgttgatattactgagaaagcaattagtatatttaaaaaatatgttgc 660
Query: 1061 tttagaagctccaaataaattagaactgtcagattctgtaagaaaattagttatatcaaa 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 661 tttagaagctccaaataaattagaactgtcagattctgtaagaaaattagttatatcaaa 720
Query: 1121 tatatgtaaaccagagggtcaaatagaagaagactgtttcaaggcagtacaggatgcatt 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 721 tatatgtaaaccagagggtcaaatagaagaagactgtttcaaggcagtacaggatgcatt 780
Query: 1181 atattatacaattgaaaaagattttttcagtggatttcaagacagcccactttacattaa 1240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 781 atattatacaattgaaaaagattttttcagtggatttcaagacagcccactttacattaa 840
Query: 1241 gtcacaaatagatattttgacaagtggttgcttgtgcttaaaagatattttatacaatga 1300
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 841 gtcacaaatagatattttgacaagtggttgcttgtgcttaaaagatattttatacaatga 900
Query: 1301 aacaattctattctattatactgaatatttagaacaagaaaattgcagtaaattactaga 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 901 aacaattctattctattatactgaatatttagaacaagaaaattgcagtaaattactaga 960
Query: 1361 atttttaatatcagtgactaattttagggataacttaataaacaacaatcctagccttga 1420
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 961 atttttaatatcagtgactaattttagggataacttaataaacaacaatcctagccttga 1020
Query: 1421 acaggcacaaggtgatgctattgttttatatgataaatatttctcactgcaagctacaag 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
Sbjct: 1021 acaggcacaaggtgatgctattgttttatatgataaatatttctcactgcaagctacgag 1080
Query: 1481 tccacttggattttcaagtgatgttcgattaaaagttgaaagtgacatctgcagtgaact 1540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1081 tccacttggattttcaagtgatgttcgattaaaagttgaaagtgacatctgcagtgaact 1140
Query: 1541 tggtcctatagcaagctgttttgattatccatataaaattatttacaaaactcttagtag 1600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1141 tggtcctatagcaagctgttttgattatccatataaaattatttacaaaactcttagtag 1200
Query: 1601 atatgttaaaacgtttttgagttctgaattatattacacttacctatcagaaatgatgaa 1660
|||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1201 atatgttaaaacgtttttgagttccgagttatattacacttacctatcagaaatgatgaa 1260
Query: 1661 atctgttaaccaaatgtggtctgcaaattataaatcatattcagattgtagcagtgaatt 1720
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 1261 atctgttaaccaaatgtggtctgcaaattataaatcatattcggattgtagcagtgaatt 1320
Query: 1721 tagtataagtacacaaaatacacttttagcaatgggtgaccaaaaatttaggaagaaacg 1780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1321 tagtataagtacacaaaatacacttttagcaatgggtgaccaaaaatttaggaagaaacg 1380
Query: 1781 aaaccactctgtacctgatatgactatagattctaatcaactttacaatgctgactcttt 1840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1381 aaaccactctgtacctgatatgactatagattctaatcaactttacaatgctgactcttt 1440
Query: 1841 atggcaaagaaagaaatatgatggcctaagcctcggaaggattaatagtttaggaagatt 1900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1441 atggcaaagaaagaaatatgatggcctaagcctcggaaggattaatagtttaggaagatt 1500
Query: 1901 tgaatcaaaatttgaacctgac 1922
||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1501 tgaatcaaaatttgaacctgac 1522
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 416,831
Number of extensions: 9686
Number of successful extensions: 9686
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 9686
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 2590
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2573
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 20890776217
Effective search space used: 20890776217
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)