BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN22525 (UTR included)
(3304 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF01026B2A06 1437 0.0
BF01024A2F03 1429 0.0
BF01040A1H10 930 0.0
>BF01026B2A06
Length = 775
Score = 1437 bits (725), Expect = 0.0
Identities = 734/738 (99%)
Strand = Plus / Plus
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Sbjct: 8 attgataccagacttatccggtatcagtaatcaacatacctcacaaagccagtcacggaa 67
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Query: 1286 acactttggaaatggaagcattgagatgtatcaaagaaattatacagtggcaacatcaag 1345
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Query: 1346 tgcagagagagttagaatagtaagagttctggttaaacacattcattcattttctgccaa 1405
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Query: 1466 gtgttcgagggcatatcattatgtaaaacatttagttatgacctggcctctggatgcctc 1525
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Query: 1526 ttttagattggtcatggaattatggcttagtctcatacagccttggaggtacactgataa 1585
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Query: 1586 ttctatcacgcaagataggtttcccagcacacagagaaatcaagaagaaggcaattctgg 1645
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Query: 1646 tactttagatcccagtttcacacaattcatagcagaaaattttccttcttatacttgcat 1705
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Sbjct: 488 tactttagatcccagtttcacacaattcatagcagaaaattttccttcttatacttgcat 547
Query: 1706 atttcaattggttctcccaagatttacaagattggatctttcggcctataaaaatgctgt 1765
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Sbjct: 548 atttcaattggttctcccaagatttacaagattggatctttcggcctataaaaatgctgt 607
Query: 1766 gatgttatttaggctaggcaaagtattttcacaactgcatctagtacccatattgtccaa 1825
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Query: 1826 tttagaaaaagctgtaacagaaaatacatcaggttggcaaagtcctgataccagttacaa 1885
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Sbjct: 668 tttagaaaaagctgtgacagaaaatacatcnnnttggcaaagtcctgataccagttacaa 727
Query: 1886 cagttccaatgttgagca 1903
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Sbjct: 728 cagttccaatgttgagca 745
>BF01024A2F03
Length = 763
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Identities = 746/755 (98%), Gaps = 2/755 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 311 gcggcgtttttccttggaaacgatattgttatcccctattatttgtttttaagatatatt 370
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Sbjct: 11 gcggcgtttttccttggaaacgatattgttatcccctattatttgtttttaagatatatt 70
Query: 371 ataatatgttattcatataaaaatcaataactaacgtgattaatgtgaaacgcaggaatc 430
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 71 acaatatgttattcatataaaaatcaataactaacgtgattaatgtgaaacgcaggaatc 130
Query: 431 gtgtctgagtgattatatatatatattattaatttgaataatttaactaatacgactata 490
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Sbjct: 131 gtgtctgagtgattata--tatatattattaatttgaataatttaactaatacgactata 188
Query: 491 ttttatggaaatggctcaagatattatgagtcagttttatacatgtctaaatttaccatt 550
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Sbjct: 189 ttttatggaaatggctcaagatattatgagtcagttttatacatgtctaaatttaccatt 248
Query: 551 gccagaaagaattttagaacttacaaggattattgatcaaagcagccctaataaggaatt 610
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Sbjct: 249 gccagaaagaattttagaacttacaaggattattgatcaaagcagccctaataaggaatt 308
Query: 611 gcaagtcctgttcccacagctcatcagtaatatattttcaccatctcttcacaatggttg 670
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Sbjct: 309 gcaagtcctgttcccacagctcatcagtaatatattttcaccatctcttcacaatggttg 368
Query: 671 gaatttacgtcaaattacaattgagggcaacagatatgaatatgaagtcttgctcagttt 730
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Sbjct: 369 gaatttacgtcaaattacaattgagggcaacagatatgaatatgaagtcttgctcagttt 428
Query: 731 tctggagccccagggtccaattttccgtttgtgctataaacttttatccgattcccattt 790
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Sbjct: 429 tctggagccccagggtccaattttccgattgtgctataaacttttatccgattcccattt 488
Query: 791 gaagtacaatttgccattgaaccttttaccattagatttgcagatgaccttagacagggg 850
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Sbjct: 489 gaagtacaatttgccattgaaccttttaccattagatttgcagatgaccttagacagggg 548
Query: 851 caggtgtccccagttttatgcagacatgctaacaatggattcacaatctctgaatgttgt 910
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Sbjct: 549 caggtgtccccagttttatgcagacatgctaacaatggattcacaatctctgaatgttgt 608
Query: 911 gtcactagctttgaatccctttgattactatattgttaattttgctttgcacttgattaa 970
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Sbjct: 609 gtcactagctttgaatccctttgattactatattgttaattttgctttgcacttgattaa 668
Query: 971 caacaatcaaaccaaaagctcgtgggaaaattggaacagtgtgtattttgctcttgcttg 1030
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Sbjct: 669 caacaatcaaaccaaaagctcgnnnnnaaattggaacagtgtgtattttgctcttgcttg 728
Query: 1031 tgattacctaatgcatttcctgccttctgatccta 1065
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Sbjct: 729 tgattacctaatgcatttcctgccttctgatccta 763
>BF01040A1H10
Length = 840
Score = 930 bits (469), Expect = 0.0
Identities = 484/488 (99%), Gaps = 2/488 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 334 tattgttatcccctattatttgtttttaagatatattataatatgttattcatataaaaa 393
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Sbjct: 1 tattgttatcccctattatttgtttttaagatatattacaatatgttattcatataaaaa 60
Query: 394 tcaataactaacgtgattaatgtgaaacgcaggaatcgtgtctgagtgattatatatata 453
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Sbjct: 61 tcaataactaacgtgattaatgtgaaacgcaggaatcgtgtctgagtgattata--tata 118
Query: 454 tattattaatttgaataatttaactaatacgactatattttatggaaatggctcaagata 513
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Sbjct: 119 tattattaatttgaataatttaactaatacgactatattttatggaaatggctcaagata 178
Query: 514 ttatgagtcagttttatacatgtctaaatttaccattgccagaaagaattttagaactta 573
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Sbjct: 179 ttatgagtcagttttatacatgtctaaatttaccattgccagaaagaattttagaactta 238
Query: 574 caaggattattgatcaaagcagccctaataaggaattgcaagtcctgttcccacagctca 633
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Sbjct: 239 caaggattattgatcaaagcagccctaataaggaattgcaagtcctgttcccacagctca 298
Query: 634 tcagtaatatattttcaccatctcttcacaatggttggaatttacgtcaaattacaattg 693
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Sbjct: 299 tcagtaatatattttcaccatctcttcacaatggttggaatttacgtcaaattacaattg 358
Query: 694 agggcaacagatatgaatatgaagtcttgctcagttttctggagccccagggtccaattt 753
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Sbjct: 359 agggcaacagatatgaatatgaagtcttgctcagttttctggagccccagggtccaattt 418
Query: 754 tccgtttgtgctataaacttttatccgattcccatttgaagtacaatttgccattgaacc 813
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Sbjct: 419 tccgattgtgctataaacttttatccgattcccatttgaagtacaatttgccattgaacc 478
Query: 814 ttttacca 821
||||||||
Sbjct: 479 ttttacca 486
Score = 490 bits (247), Expect = e-138
Identities = 267/277 (96%)
Strand = Plus / Plus
Query: 822 ttagatttgcagatgaccttagacaggggcaggtgtccccagttttatgcagacatgcta 881
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Sbjct: 564 ttagatttgcagatgaccttagacaggggcaggtgtccccagttttatgcagacatgcta 623
Query: 882 acaatggattcacaatctctgaatgttgtgtcactagctttgaatccctttgattactat 941
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Sbjct: 624 acaatggattcacaatctctgaatgttgtgtcactagctttgaatccctttgattactat 683
Query: 942 attgttaattttgctttgcacttgattaacaacaatcaaaccaaaagctcgtgggaaaat 1001
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Sbjct: 684 attgttaattttgctttgcacttgattaacaacaatcaaaccaaaagctcgnnnnnaaat 743
Query: 1002 tggaacagtgtgtattttgctcttgcttgtgattacctaatgcatttcctgccttctgat 1061
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Sbjct: 744 tggaacagtgtgtnntttgctcttgcttgtgattacctaatgcatttcctgccnnntgat 803
Query: 1062 cctaatgttgccgttctgccacacataccacactaca 1098
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Sbjct: 804 cctaatgttgccgttctgccacacataccacactaca 840
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 442,073
Number of extensions: 13029
Number of successful extensions: 13029
Number of sequences better than 1.0e-10: 3
Number of HSP's gapped: 13026
Number of HSP's successfully gapped: 4
Length of query: 3304
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 18
Effective length of query: 3286
Effective length of database: 8,109,745
Effective search space: 26648622070
Effective search space used: 26648622070
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)