BLASTN 2.2.24 [Aug-08-2010]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= DPGLEAN22565 (UTR included)
(2446 letters)
Database: est
9484 sequences; 8,280,457 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
BF14_1928_C1 3388 0.0
>BF14_1928_C1
Length = 1835
Score = 3388 bits (1709), Expect = 0.0
Identities = 1779/1801 (98%), Gaps = 1/1801 (0%)
Strand = Plus / Plus
Query: 533 agatgctgtgagtaaaaaaacttttcccaccataaacccacaagatgaaactgttatcgc 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 35 agatgctgtgagtaaaaaaacttttcccaccataaacccacaagatgaaactgttatcgc 94
Query: 593 caatgttgccgaaggagacaaggctgacatagacatagcagtggaagcagctcgtaaagc 652
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 95 caatgttgccgaaggagacaaggctgacataaacatagcagtggaagcagctcgtaaagc 154
Query: 653 atttcacagatattcaaaatggcgtactatggatgcatcccaaagaggtttgcttatgtt 712
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 155 atttcacagatattcaaaatggcgtactatggatgcatcccaaagaggtttgcttatgtt 214
Query: 713 aaaactggcagaacttatggattcccaagcaaaatatttggcagaactagagactttgga 772
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 215 aaaactggcagaacttatggattcccaagcaaaatatttggcagaactagagactttgga 274
Query: 773 ctgcggtaaacctgtcaagatagctgaagaagaggtccactcttcagctggggtattgag 832
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 275 ctgcggtaaacctgtcaagatagctgaagaagaggtccactcttcagctggggtattgag 334
Query: 833 atattatgcaggaaaagctgacaaaatattgggcaacactataccggccgatggtgaatg 892
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 335 atattatgcgggaaaagctgacaaaatattgggcaacactataccggccgatggtgaatg 394
Query: 893 tttgtctatgacattgaaagaacctgttggcgtgtgtggacagattattccatggaatta 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 395 tttgtctatgacattgaaagaacctgttggcgtgtgtggacagattattccatggaatta 454
Query: 953 tcccataccaatgatatcatggaaacttggaccagctctggcggctgggtgtacaatagt 1012
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 455 tcccataccaatgatatcatggaaacttggaccagctctggcggctgggtgtacaatagt 514
Query: 1013 attgaagcccgcggaacaaactccactaactgcgctagctgtggcggcgttagtgaagga 1072
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 515 attgaagcccgcggaacaaactccactaaccgcgctagctgtggcggcgttagtgaagga 574
Query: 1073 ggctggcttcccgccgggcgttgtaaatgttgttcctggatacggtccgaccgcaggggc 1132
|||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||
Sbjct: 575 ggctggcttcccgccgggcgttctaaatgttgttcctggatacggcccgacagcaggggc 634
Query: 1133 agccctaacgcaccacccacacgtcgacaagatagcattcacaggctccacagaggtcgg 1192
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
Sbjct: 635 agccctaacacaccacccacacgtcgacaagatagcattcaccggctccacagaggtcgg 694
Query: 1193 aaaattaatattgggtgcagcgtcggtt-gctaaccttaaaagagtgacgttggagttgg 1251
|||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 695 aaaattaatattgggtgcagcgtcggtttgctaacctcaaaagagtgacgttggagttgg 754
Query: 1252 gtggaaagagccctctggtggtgtttaatgatgctgatgttgagaaagctgcaagaatag 1311
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 755 gtggaaagagccctctggtggtgtttaatgatgctgatgttgagaaagctgcaagaatag 814
Query: 1312 ctcatgcagcggcctttgctaatggagggcaatgttgttgtgctggcacaaggacctacg 1371
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 815 ctcatgcagcggcctttgctaatggagggcaatgttgttgtgctggcacaaggacctacg 874
Query: 1372 tacaatctgggatatacgaggccttcgttaacaaggcggcagagatcgccaaccaaaggt 1431
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 875 tacaatctgggatatacgaggccttcgttaacaaggcggcagagatcgccaaccaaaggt 934
Query: 1432 ccgtcggcaacccttatgatgaagtagatcaaggacctcagatcgaccaagagatgttca 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 935 ccgtcggcaacccttatgatgaagtagatcaaggacctcagatcgaccaagagatgttca 994
Query: 1492 gcaaagttcttggttatattgattccggaaagaattctggggctagatgtgtcgctggag 1551
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 995 gcaaagttcttggttatattgattccggaaagaattctggggctagatgtgtcgctggag 1054
Query: 1552 gggatagaattggtgataagggatactatattaaacctacagtttttgctgacgttgaag 1611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1055 gggatagaattggtgataagggatactatattaaacctacagtttttgctgacgttgaag 1114
Query: 1612 atgatatgaaaatagcaagggaagagatatttggtccagtccagagcatactgaagtttg 1671
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1115 atgatatgaaaatagcaagggaagagatatttggtccagtccagagcatactgaagtttg 1174
Query: 1672 atacattcgaggaggtgattgatagagccaatgacactaactatggtctgggagctggtg 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1175 atacattcgaggaggtgattgatagagccaatgacactaactatggtctgggagctggtg 1234
Query: 1732 ttataacaaacgatattactattgcaatgagctttgcaagacacgtccgtgctggatcta 1791
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
Sbjct: 1235 ttataacaaacgatattactattgcaatgagctttgcaagacacgtccgtgctggatcca 1294
Query: 1792 tatggattaatacctatgaccatgttacaagtcaaactccgtttggtggtttcggtgact 1851
||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1295 tatggatcaatacctatgaccatgttacaagtcaaactccgtttggtggtttcggtgact 1354
Query: 1852 ctggtatgggcagggaactaggtgaagatggtatactgccttatcttgaaactaaaacta 1911
|||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1355 ctggcatgggcagggaactgggtgaagatggtatactgccttatcttgaaactaaaacta 1414
Query: 1912 ttacgttagcactgcctaagcatccacaattctaatggtgaaaaattttacatacataat 1971
||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1415 ttacgttagcactgcctaaacatccacaattctaatggtgaaaaattttacatacataat 1474
Query: 1972 aatgaagaatgaatgaaaattatttattgattactattaattgcaataaaaatttataat 2031
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct: 1475 aatgaagaatgaatgaaaattatttattgattactattaattgcaataaaaatgtataat 1534
Query: 2032 ttgttaacaatgttcgtctctttcattaaacgtacatatttattcttgtagtaggaaaaa 2091
|||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1535 ttgttaacaatgttcgtctctttcattaaatgtatatatttattcttgtagtaggaaaaa 1594
Query: 2092 tagacatccaattgtgtaatatcaagtttgaatgtcaagtttatttattgtagtgaagaa 2151
|||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1595 tagagatccaattgtgtaatatcaagttagaatgtcaagtttatttattgtagtgaagaa 1654
Query: 2152 taataacggtaatctacaaaaattcatcgtaaacaaaaacaacatcagcttctcaagaag 2211
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1655 taataacggtaatctacaaaaattcatcgtaaacaaaaacaacatcagcttctcaagaag 1714
Query: 2212 cgttgacaaaaaacgacaaataatcccgttggaaatacaccgcttcgatggataaatcaa 2271
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1715 cgttgacaaaaaacgacaaataatcccgttggaaatacaccgcttcgatggataaatcaa 1774
Query: 2272 gagcaaacaaactagtttttttccaagtcgttccataacttaaagatttgtttgtgagcg 2331
|||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
Sbjct: 1775 gagcaaacaaactagtttttgtccaagtcgttccatagcttaaagatttgtttgtgagcg 1834
Query: 2332 a 2332
|
Sbjct: 1835 a 1835
Database: est
Posted date: Jul 14, 2011 2:25 PM
Number of letters in database: 8,280,457
Number of sequences in database: 9484
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 5, Extension: 2
Number of Sequences: 9484
Number of Hits to DB: 287,397
Number of extensions: 5678
Number of successful extensions: 5678
Number of sequences better than 1.0e-10: 1
Number of HSP's gapped: 5677
Number of HSP's successfully gapped: 1
Length of query: 2446
Length of database: 8,280,457
Length adjustment: 17
Effective length of query: 2429
Effective length of database: 8,119,229
Effective search space: 19721607241
Effective search space used: 19721607241
X1: 11 (21.8 bits)
X2: 15 (29.7 bits)
X3: 50 (99.1 bits)
S1: 12 (24.3 bits)
S2: 34 (67.9 bits)