New model in OGS2.0 | DPOGS210037  |
---|---|
Genomic Position | scaffold470:- 51288-54617 |
See gene structure | |
CDS Length | 3330 |
Paired RNAseq reads   | 730 |
Single RNAseq reads   | 1868 |
Migratory profiles | Query via corresponding ESTs |
Best Bmobyx hit | BGIBMGA000468 (0.0) |
Best Drosophila hit   | dispatched (2e-153) |
Best Human hit | protein dispatched homolog 1 (5e-133) |
Best NR hit (blastp)   | hypothetical protein AaeL_AAEL010401 [Aedes aegypti] (0.0) |
Best NR hit (blastx)   | dispatched [Culex quinquefasciatus] (0.0) |
GeneOntology terms    | GO:0007224 smoothened signaling pathway GO:0016021 integral to membrane GO:0016020 membrane GO:0006887 exocytosis GO:0008158 hedgehog receptor activity GO:0007280 pole cell migration |
InterPro families    | IPR000731 Sterol-sensing domain IPR003392 Patched |
Orthology group | MCL11554 |
Nucleotide sequence:
ATGTTATCTGCTTATGCCAGGTTTATTGTTCGCTACTCTTACTTTTTCCTTTTTATTATA
ATAGTAATATCGACAGTCCTGACAGTCATTCCACTATTATGTCACGAGATACCATCCTTT
TCCGATCCAGTGGTCGGTTTTGAAACAAGAGGGACTACATTAGCGCACCGATTTATTGCT
TGGGAAAATCTTAATGATGAAACACGACCGTCTAAAAGGCTAGCAGTTAATCCTAAGGAA
ATAGAAGATCAAATACGAATGAATGAAACATACAACAAGAAAAAACAGGATAAATCAAGA
TCTGGCAAAAAACATCCCAAAAAAAAACACAGAAAGAAGTTGCACAACAACACTGGATTT
GCGAAAACATTGTTTAATTCGCCAGAGTTTAATGCTAGCAAGGGCCATGTCCATTGGGGC
TATGGTAAAAATGTTTCCTTTGAAGATGAAAATACAGTTTTTCTTAAAGATCACACAAGG
AATCAATGGAAATCTATACTTAAAATGCAGCAATCTTCTGGAAATGTAGTATTTCATAAT
TATGCCTCTGGTGTGTGTGGGGCACCTGTTGCTGATTATGCACATTTGGTGGTGTCTTCT
ACAGATGGAAAATCAATGCTCTCTTTCGAAAATGTTAAAAGAATGTGTCAATTGCAGTCC
CTGCTCATTGAAATGGGTGAAGAAGAGTTCTACAACTTATGCCAACGACCATTACATTCA
GAAGAACTCTGCTGTCCTACATGGAGTGTGCCAAATTATATAGCTTTAATATCTGGTAAG
GATTCATGTGAAAATATTACAAAAAGCGATGTTGAAAATGTTGTGAATATTTTATTAAAA
TGTGCAAGTTACTTTCATAACTTTACTTTGATGGCGTCATGCGAATTAGGTAGATGCAGG
GTACCAAGCTACTGTTCACAGTACGATGCTGTATATAACTTACTATTTTATATTATAGAC
TCTAAAGCTTTTTCTCCCCCAACATTCTCGGAAACATTTGTCGAGAATGTTATGATTTTT
CTTCCACTACCCAGCAGTGGCACAACCCTACCTTACTACATGAAACTACAAAACTTTGGT
TGGTCCTATGAAACTCTTGTGGTCCCCGCGATTGACTTTGGTTTAAAAAATGCTTTATTT
GACCTGTGGATAATAGAAGACACTTGGCTAATGGGCCTTGGAGGCCTTTTTGTATTCATT
TGCATTTGGATTTATACCAAATCTCTACTTCTCACTATCTTGTTGTTTACCGCAATCACA
TACTCCCTTGGAGTTGCATATTTTCTTTATGTATACGTCTTTAACTTGGAATTTTTTCCA
TTTATGAATTTATTAGTGATAGTCGTTGTGATTGGTATTGGGGCTGATGATGCTTTCCTC
TATGTAAAAGTTTGGAATATGATCAGCAAGCAGCTCATTAAAGATAATATTGTGTGTGAC
AATGACGATTTAGAAAATATAAAAAATGTATCCAGTGCTGGCGAGACTATTCTTGTGCAA
ATACTATCGGAGACTTTAAAGCACTCCATTCTTGCAATATTCATCACAACCTTGACAACT
GCTATTGCATTTTACGCTTCATATATCAGTTACATTCCTGCGATTAATTGTTTCAGTGTT
TTTGCTGGGACGGCAGTATTAGTCAACTTTTTTCTTATGGTCACTTGGCTGCCAGTATCA
GTATATATATTAGATGTAAAATTATGTATTAATAGATGGACATTGTTAGGTGCAATTAGT
GATGCTGTTAATGAGATTGGTGAGGATATCAAAGTTATATTAAATAGATTTATAATAACT
TGTATAATGAGGTTGCATATATGTTTAGTAGTGATTCTGGGTGCTATAGGAATTGGCAGT
ATTGTAGTCGTTTTTTACTATCCGGGACTTCAACTTCCAGACTCTAAACAGTTTCAGTTG
TTTCAATCTTCACATCCTTTTGAACAATATGATATTCACTACAAAGCAAAGTTTTTATTC
GAAAGATTCGGCCGCAACACAGAGATCGGTGCTAAAATGCCTCTCAGATGGGTTTGGGGT
GTCCAGGCTGTTGACAATGGAGATCACATGAATCCCTTCTCAAAAGGAGAACTCGTTTTT
GACACAAGTTTCAATATTTCAAATCCAAATTCCCAAAAATGGCTGTTAGAGTTCTGTACT
AAAATAAAAAGGCAGCCGTTTTATCAGCAAACTTTGGGACCTCTTTTGCCAAATTGCTTT
ATTGAAAGTTTCAAAGCGTATATGAGTAGGAGGTGCATAGATAATATCGACAAGATTAAC
AGATCGCCATGCTGCGAATCATCCCGATTTCCTTACGATACAGAAGTTTTTAACTTTTGC
ATCATAAAAGCTATGGAGTCGTTATACCAAACACCCCGCGAATTGTTTATGCCTGGAGTC
GCCGGTCCTAAATTCTTGAGACGTTCAAATCCCCCCACCATTGCCGCAGTGGTCGTAGAG
TTTGAAAGTGTCGTACCTTATTCGATGTCATATAAGGAGATGGATGATTTTTATCTTCAA
GTCGAGAACTGGACGGTTCAAGAATTGAAAAATGCTCCTGAGGGGATGAAGCATGGATGG
TTTCTATCTGACCTTCAATTCTATGACTTACAAAACACCTTAGCAAGTGGTACTGTGGTA
GCTCTACTGTTGTCAGCTGGTTTAGGTTTTATGGTACTTGTTCCGTCAACGTTCAGTTTT
ATAGTCAGCTCCTGTGCTCTATTGGCCATGATATTTTCGTCGACCGTTACAATAGCCATA
TTAGTATTAAACGATTGGAAGTTGAATATATTAGAAAGTATAGCAATATCGACATCAGCA
GGGTTAGCTGTAGATTTTAGTCTGCATTATGCATTAAGTTATACAAACTCTAATGGACCT
AAATCCACAAGAGTTAAATTCGCTCTTTCGGCATCATCAGGACCTACCGCAGCGGCTGCT
CTTACAACAGGTTTCGCTGGCATATTTTTAATACTTTCGAATCTTCTCCCCTATTCACAA
ATAGGGACGTTCCTTGCATTAATAATGTCAGTCAGTTGGATTTATTCGACATTTTTTCTA
TGTTCTCTATTGTATTTGTTCGGGAGGAATTCCGCTAAAGAAACGCCTGCCGATGAAACC
AAATCCATTTCACGTGTAAGTTCAATATGTTCTGCTGTGCCGAACTTAGAGAGTCACGAG
TTAGAACATTTAGCAGACAGCAATCGCACAAATATTACACACTCCCATAGTACTTGCGTT
AGCGCAACGACAGTGGTCATCCACGACGACGCTGAGAACGCGCTGGAGAAAGCTGAGAAG
AAACCTAGCGTTGATATAATTAACGACTGA
Protein sequence:
MLSAYARFIVRYSYFFLFIIIVISTVLTVIPLLCHEIPSFSDPVVGFETRGTTLAHRFIA
WENLNDETRPSKRLAVNPKEIEDQIRMNETYNKKKQDKSRSGKKHPKKKHRKKLHNNTGF
AKTLFNSPEFNASKGHVHWGYGKNVSFEDENTVFLKDHTRNQWKSILKMQQSSGNVVFHN
YASGVCGAPVADYAHLVVSSTDGKSMLSFENVKRMCQLQSLLIEMGEEEFYNLCQRPLHS
EELCCPTWSVPNYIALISGKDSCENITKSDVENVVNILLKCASYFHNFTLMASCELGRCR
VPSYCSQYDAVYNLLFYIIDSKAFSPPTFSETFVENVMIFLPLPSSGTTLPYYMKLQNFG
WSYETLVVPAIDFGLKNALFDLWIIEDTWLMGLGGLFVFICIWIYTKSLLLTILLFTAIT
YSLGVAYFLYVYVFNLEFFPFMNLLVIVVVIGIGADDAFLYVKVWNMISKQLIKDNIVCD
NDDLENIKNVSSAGETILVQILSETLKHSILAIFITTLTTAIAFYASYISYIPAINCFSV
FAGTAVLVNFFLMVTWLPVSVYILDVKLCINRWTLLGAISDAVNEIGEDIKVILNRFIIT
CIMRLHICLVVILGAIGIGSIVVVFYYPGLQLPDSKQFQLFQSSHPFEQYDIHYKAKFLF
ERFGRNTEIGAKMPLRWVWGVQAVDNGDHMNPFSKGELVFDTSFNISNPNSQKWLLEFCT
KIKRQPFYQQTLGPLLPNCFIESFKAYMSRRCIDNIDKINRSPCCESSRFPYDTEVFNFC
IIKAMESLYQTPRELFMPGVAGPKFLRRSNPPTIAAVVVEFESVVPYSMSYKEMDDFYLQ
VENWTVQELKNAPEGMKHGWFLSDLQFYDLQNTLASGTVVALLLSAGLGFMVLVPSTFSF
IVSSCALLAMIFSSTVTIAILVLNDWKLNILESIAISTSAGLAVDFSLHYALSYTNSNGP
KSTRVKFALSASSGPTAAAALTTGFAGIFLILSNLLPYSQIGTFLALIMSVSWIYSTFFL
CSLLYLFGRNSAKETPADETKSISRVSSICSAVPNLESHELEHLADSNRTNITHSHSTCV
SATTVVIHDDAENALEKAEKKPSVDIIND