DPGLEAN21816 in OGS1.0

Genomic Positionscaffold501:+ 37240-40377
See gene structure
CDS Length2988
Paired RNAseq reads  448
Single RNAseq reads  1205
Migratory profilesQuery via corresponding ESTs
Best Bmobyx hitBGIBMGA011037 (2e-07)
Best Drosophila hit  Toll-7 (0.0)
Best Human hitslit homolog 1 protein precursor (2e-25)
Best NR hit (blastp)  18 wheeler [Bombyx mori] (0.0)
Best NR hit (blastx)  18 wheeler [Bombyx mori] (0.0)
GeneOntology terms






  
GO:0005886 plasma membrane
GO:0004888 transmembrane receptor activity
GO:0006952 defense response
GO:0016021 integral to membrane
GO:0007165 signal transduction
GO:0005515 protein binding
GO:0031224 intrinsic to membrane
GO:0045087 innate immune response
InterPro families


  
IPR000157 Toll-Interleukin receptor
IPR001611 Leucine-rich repeat
IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR000372 Leucine-rich repeat-containing N-terminal
Orthology groupMCL10076

Nucleotide sequence:

ATGTCTTTGCCAGCTGACTCTGAAATATTACATCTGCGGAGGCTTAATCAGTTATTCTTA
CAAAACAATAAAATAAGTGAACTGCCGACTGAAGTTTTTAGCGACCTGCTTTCGTTAAAA
GTTGTAAATCTATCGGAAAATGCTATAAATTACCTACCGGAAGGTTTATTTCAGAATACA
AAGGAAATTCGTGAAATTTATCTTAACCATAATGATTTGGAAATATTACCGAAGAAATTA
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GAAGATAACGCATTTTCACCGTTATTTAATCTGCATACCTTAAATTTAGGACTAAATAAG
CTACATTCTATCGGAGATCATGTTTTTAATGGCCTTTTTATTTTAAATAAATTAAATTTG
AACAATAATATGTTATCATCCATTGCCGTTGACGGTTTTAAAAATTGCTCGGATCTTAAA
GAATTAGATCTTAGCTCTAACAAATTGTCGAAAGTTCCAGAAGCCATACTACAATTATCC
TTTCTGAAGTCATTGGATCTGGGAGAGAATATATTGATAGAGATATCGAACAACTCGTTT
CAAAACTTATCCCAGTTGACTGGGTTGCGTTTAATAGACAATCAAATTGGAAACCTTACT
GCGGGAATGTTTTGGGGCTTGCCTAGCCTCCAAGTCCTCAATTTGGCAAAAAATAAAATA
CAGTCTATTGAGACCGAAACCTTTCAAAAGAACCTGCAATTGGAAGCCGTTCGATTGGAC
GGCAACTTTATTTCTGATATAAACGGGGTATTTGTGTCACTGACAAAGTTGTTATGGCTT
AATCTATCTGAGAATCATTTAGTATGGTTTGATTATGCTTTTATTCCATTTAGTTTAAAA
TGGTTGGATATACATGCTAATTTTATAGAAGTGTTAGGTAATTATTATAAAATTCAAAAG
GATTTGCATGTTAAGACATTAGATGCGAGTCATAATCGTATAGTCACTCTGTCTGCTTTG
TCTATACCTAATAGTGTCGAGTTACTCTTTATCAATAATAATTTTATTTCTAGCGTTGCA
CTCGATACATTCTTAGAGAAGAGCAATTTGACACGGGTTGATATGTATGCCAATGAAATT
GAAAGTTTAGATATAAATAGCTTACGTATCTCTAGAGTAGATGATAAAGCTTTACCTGAA
TTCTATATCAGTGGAAACCCATTTAAATGTGACTGCACGATGAAATGGTTGTTACTGATA
AATTCTCTAACATCAAATCAATACCCGCGCGTAATGGATTTAGATAATGTTATATGTAAG
GAATCATATGTTAGAGGAGTTAAATTTCATTCTGTTAGTTCATTTCATACAAAAGATTTT
CTTTGTAAATATGACAGTTATTGTCCAGAAGATTGTCATTGTTGCGATTTTACATTTTGC
AATTGCAAAACGGTATGTCCAAATAACTGTTCATGTTATCACGATTCAACAAAGACCACA
AATGTTGTCGATTGTTCTGTAAAACAATTGAATATGGTGCCACGGGAATTCCCGACGAAC
GCAACGCATATTTATTTGGATGGAAATCATTATAATGAACTTAATGAAACCATTTTCGAG
TACATGCGTAAATCAATAGTTCTATACTTAAATTCTAGTAATATTAATACAATACAAAAC
AATACATTTCGTGAACTAATTGACTTAAAAATACTACATTTGGAAAATAATAAAATAAAA
CGTCTGCAGGGGCTGGAATTTGCTAGGTTGAATAACTTAAAAGAATTATATCTTCAGAAT
AATTTAATAGAGTTCATATCAAACTCAAGTTTTTCTATGCTCAGTGCCCTTGAAGTGTTA
CGATTGGATGGAAATAAATTAATCAACTATGGCTTGTGGCATTTAGATAACAATAAAAAA
TTACAATCCTTATTTTTGGGAAATAATTACTGGTCTTGTCACTGTAAATATTTACAGGGA
TTTCTGATTTACATTTCACAGAACGTTGAAAAAGTAATAGACCTCCATAATCTGTGGTGC
TTGAATGATAATGTAAGCCCAGCAAAGAAGCCATTGAATTTAAATGTGACAGTGTGCAGC
GAAATAAGTGATAGCTCAATGATAAGCGCCTTCTTCGTTTCCCACAACATACCATTACTA
GCGTCGGCTCTCACTGGCTTCATGCTGATTTTATTAATATTAGCTTTAGTATTCACATTT
AGATACGCTTGCAGAATGTGGTTGTATTCTAATTGCGGTATTAAGCTTTCGCCCTTAGCG
GGCGCCTTTAACGATGCTGATAAACTTTACGACGCTTACATTTGTTATAGTCCCAAGGAT
GAGGAATTTGTCGTGGAGTCTTTAGCGCGGGAGCTGGAAAACGGTTATCCTTCATACCAT
TTATGTCTACATTATAGAGACGTGCCGCAATTTGAAGCAACATATGCTCAGTTTCCCGAT
TTGGTAGTCGAAGCGACAGAGGCGTCGAGACGTATTATAGTAGTGTTATCTAAAAACTTT
ATATTAACTGAATGGTCACAAATAGAGTTTAGGCAAGCGTTACAGAGGGCTCTTCGTAAA
AATCCTCATAAGTTAATTGTAGTCGTCGTAGGGCTACTAGCTCGAGATCCGGAATTAAAA
TCATATTTCAAAAGTGCTTTGGAGATAACATGGAAAGAGAAAAGATTTTGGGAGCGATTA
CGATATGCGATGCCGTCATGTAAGCGACGCGGGCACAAATTGAAGAGGCTTAATTATGGA
AGAAATTCCAACACGTACACAATGGACGCGTCGGTGCTAAATAGTACCTGTCAAACGCTC
TGCGGCAAATCCGCAAATTCAGTAGAACGTTCTCCTTGTGACAGGCCGTTGTCCGAGCAC
ATATATTCCACTATAGATTCGGATTATTCGTCAAACGATTTCCAAGGCCGCCACAATCAC
CAACAATCAGTGGTATTGCATCACACAGTTCAAACGTACCTGGTCTAA

Protein sequence:

MSLPADSEILHLRRLNQLFLQNNKISELPTEVFSDLLSLKVVNLSENAINYLPEGLFQNT
KEIREIYLNHNDLEILPKKLFNRLEQLVILNLSNNSISFIEDNAFSPLFNLHTLNLGLNK
LHSIGDHVFNGLFILNKLNLNNNMLSSIAVDGFKNCSDLKELDLSSNKLSKVPEAILQLS
FLKSLDLGENILIEISNNSFQNLSQLTGLRLIDNQIGNLTAGMFWGLPSLQVLNLAKNKI
QSIETETFQKNLQLEAVRLDGNFISDINGVFVSLTKLLWLNLSENHLVWFDYAFIPFSLK
WLDIHANFIEVLGNYYKIQKDLHVKTLDASHNRIVTLSALSIPNSVELLFINNNFISSVA
LDTFLEKSNLTRVDMYANEIESLDINSLRISRVDDKALPEFYISGNPFKCDCTMKWLLLI
NSLTSNQYPRVMDLDNVICKESYVRGVKFHSVSSFHTKDFLCKYDSYCPEDCHCCDFTFC
NCKTVCPNNCSCYHDSTKTTNVVDCSVKQLNMVPREFPTNATHIYLDGNHYNELNETIFE
YMRKSIVLYLNSSNINTIQNNTFRELIDLKILHLENNKIKRLQGLEFARLNNLKELYLQN
NLIEFISNSSFSMLSALEVLRLDGNKLINYGLWHLDNNKKLQSLFLGNNYWSCHCKYLQG
FLIYISQNVEKVIDLHNLWCLNDNVSPAKKPLNLNVTVCSEISDSSMISAFFVSHNIPLL
ASALTGFMLILLILALVFTFRYACRMWLYSNCGIKLSPLAGAFNDADKLYDAYICYSPKD
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