| New model in OGS2.0 | DPOGS207774 |
|---|---|
| Genomic Position | scaffold770:+ 43353-45029 |
| See gene structure | |
| CDS Length | 1677 |
| Paired RNAseq reads | 499 |
| Single RNAseq reads | 1529 |
| Migratory profiles | Query via corresponding ESTs |
| Best Bmobyx hit | BGIBMGA005329 (0.0) |
| Best Drosophila hit | CG3149 (5e-126) |
| Best Human hit | protein RFT1 homolog (2e-70) |
| Best NR hit (blastp) | PREDICTED: similar to conserved hypothetical protein [Tribolium castaneum] (6e-170) |
| Best NR hit (blastx) | PREDICTED: similar to conserved hypothetical protein [Tribolium castaneum] (2e-145) |
| GeneOntology terms | GO:0016021 integral to membrane GO:0006869 lipid transport GO:0005319 lipid transporter activity |
| InterPro families | IPR007594 RFT1 |
| Orthology group | MCL15456 |
Nucleotide sequence:
ATGGGTCGCAATTTATTGATGAGTAGCCTCGAAAATGCATCCTTTAATATACTCCTGCAA
ATATTGTTTAGATGCGTAACTTTCATAATTAATGCATGGGTTATTAGAAATGTTGGTCAT
GAAGTTATTGGTATTATGAATGTCAGGTTATTGTTGCTTGAAAGTACTATATTATTCCTA
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GTGTCCCAACTCTATTGTTTTGTCAAGTTAAAAATTATTTTGGACACTTTGCACATATTT
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TATTGGTACATAAAATGTAAACCGTTATATGCAAAAGGTGCTCTGAAGACTCGGTTTCTG
TCTGCTAAAACTCTGGATACTCTTTTCAGTGACATGGATGATTTTAATTTTATATCTCTG
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GTTAATAACTTAGGAAGTCTTGCTGCAAGATTTGTATTTCGACCAATCGAAGATAGCAGT
TACTTTTATTTCACACAAATGGTTAGTCGTGATCTTCCCTTGTATAAGCAAGATCGGAAC
AAAATCCACGAATCTTGTACAGTGTTATATCAAGTTTGTAAAACTGTTAGTTCTATAGGT
TTAATTGTATTGGTTTTTGGACTCAGTTATTCTTCTACATTACTAACTTTGTATGGAGGG
GAAGCGTTTGTAGCCAGTGGATTACCAGTTACTTTACTTCAAAGCCATTGTTTCGCTATT
GTGCTAATGGCTGTCAATGGCATAACAGAATGTTACACGTTTGCTACAATGACTAGTGCC
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TATGTATTGACATACGTTTTTGGTCCAGTTGGTTTTATTATATCTAATTGTATAAATATG
TTCGCAAGGATTTTGCATAGTGTACATTTTATTAACGATAAACATAAGGATACAGATCAT
AGACCTTTGCACGGTCTGTACGTCGGAAAATTATTTCTATTTACATTGTTTTTGGCTGGT
TGTATCTGCAAAGCATCTGAACATAATCTTTCTAAAAATATGTTAACCCATATAGCAATT
GGAATGGTATGCCTATTTTTTGTACTGTTATCTTGGAGTGTAGAAAATAAAGATCTCTTA
AAGAAAATATACGCAAAATTCACAAGGACAGAAGAAAACAAAGTTTCAACAGACTAA
Protein sequence:
MGRNLLMSSLENASFNILLQILFRCVTFIINAWVIRNVGHEVIGIMNVRLLLLESTILFL
SREPFHRACLGQKGEFNWNQVINQIWLSVPLSCVLSSIFIYIWLNILPLGHPEHSSQYTF
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RDFFPKYLGSINSCFNKKLNTLTLSFAKQGVVKQLLTEGEKYVMSASPVMTFSEQATYDV
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QLNSYNYLMVFFSISFLILSYVLTYVFGPVGFIISNCINMFARILHSVHFINDKHKDTDH
RPLHGLYVGKLFLFTLFLAGCICKASEHNLSKNMLTHIAIGMVCLFFVLLSWSVENKDLL
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