DPGLEAN22374 in OGS1.0

Genomic Positionscaffold1226:- 28255-31584
See gene structure
CDS Length3330
Paired RNAseq reads  67
Single RNAseq reads  213
Migratory profilesQuery via corresponding ESTs
Best Bmobyx hitBGIBMGA011038 (2e-13)
Best Drosophila hit  Toll-7 (0.0)
Best Human hitslit homolog 1 protein precursor (9e-31)
Best NR hit (blastp)  18 wheeler [Bombyx mori] (0.0)
Best NR hit (blastx)  18 wheeler [Bombyx mori] (0.0)
GeneOntology terms






  
GO:0005886 plasma membrane
GO:0004888 transmembrane receptor activity
GO:0006952 defense response
GO:0016021 integral to membrane
GO:0007165 signal transduction
GO:0005515 protein binding
GO:0031224 intrinsic to membrane
GO:0045087 innate immune response
InterPro families


  
IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype
IPR000372 Leucine-rich repeat-containing N-terminal
IPR000157 Toll-Interleukin receptor
IPR001611 Leucine-rich repeat
Orthology groupMCL10076

Nucleotide sequence:

ATGAAAAGTATTGACCGTCTTGGGTTTGGAAAAAGCTGTGGGACTGGCTTGAGAAGTTTA
GATATAAGCCAAAATGAACTAAAATCTCTTAGTGAGGAATCAGAAATATCAGGACTACGT
CATCTTCAAGAATTGAAACTGCAACATAATAATATTTCGGATATTTCAGATGAAATATTC
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CATAGCATTGCAATAGGTAATAATATGTGGTCTTGTAAATGTAGATATTTACAAAAATTT
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AATGTAGGAAACAAATATCCGCAAAAAAAGGAATTAAATATTAATGGCACCATTTGTAGC
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ATTGGAGCTTATGATGGCACTGATAAGTTATATGATGGATATATATTATATAGTCCCAAA
GATGATGACTTCGTCATACAAACATTAGCCGGGGAGTTGGAAAATGGAAATCCACAATAC
CACCTTTGTTTACATTATCGCGATATACCTCAACATGGTGCTGCTTATATGCAGTACACT
TTACCACTTCCCGAAGCTGCGAAAGCCTCTAAGAGAATAATTCTTATATTAACGAGAAAT
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TCTCGAATTTGTACTTTAATTATAATTCAAGAGAGTTCAATTTTAACTGACGCAGAATGT
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TCGTTTTCTTTTACTGAAAAAATAAAAGAACCCAGTGACGTTGTTTCTGCTACACCTGAG
TATATGGAAAGTCGATCGCATCATCCCAACTCTGCATATTCAACAGATGGTAGGCCGCCA
TCTGATCATATTTATTCGTCAATAGATTCAGATTACTCATCTTTAGAATTAGGTGGGAAT
AATCCGGGTAGAAGACGCGAGTTCAGACACTGGCCTCCTCCTCCTCCTTTAATTGATACA
CAATATTCAGGCCAAGCTTATCTTGTCTAG

Protein sequence:

MKSIDRLGFGKSCGTGLRSLDISQNELKSLSEESEISGLRHLQELKLQHNNISDISDEIF
NGLISLRILNISYNNLQIIPEGIFANTKELREIYLNNNQLFELARGVFHRLEQLLVLDLS
NNQLSSTHIDGGTFISLIRLVILNLSNNALTRIDGKTFKDLFFLQILDLKNNSIGYIEEN
TFLPLYNLHTLNLAENRLHTIDEYLFNGLFVLSKLNLNNNLLISIDPKAFKNCSDLKELD
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ENHLVWFDYAFIPSNLKWLDVHGNFIEYLGNYYKIQDEIRIKTLDVSHNRILEISPLAIP
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VGGNPFDCDCSMEWLPLINNMTSTRQYPRIMDLENVLCKMTHTRGVSHIPLSTLKSTDFL
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SFSFTEKIKEPSDVVSATPEYMESRSHHPNSAYSTDGRPPSDHIYSSIDSDYSSLELGGN
NPGRRREFRHWPPPPPLIDTQYSGQAYLV