Monarch geneset OGS2.0

DPOGS201656
TranscriptDPOGS201656-TA12561 bp
ProteinDPOGS201656-PA4186 aa
Genomic positionDPSCF300254 + 212892-250165
RNAseq coverage13x (Rank: top 82%)
Annotation
HeliconiusHMEL0124550.038.36% 
BombyxBGIBMGA003039-TA0.038.71% 
DrosophilaDhc36C-PB0.039.59% 
EBI UniRef50UniRef50_E0VBG00.054.03%Dynein heavy chain, cytosolic, putative n=17 Tax=Opisthokonta RepID=E0VBG0_PEDHC
NCBI RefSeqXP_975424.20.058.15%PREDICTED: similar to dynein, axonemal, heavy polypeptide 1 [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastpgi|1892363460.058.15%PREDICTED: similar to dynein, axonemal, heavy polypeptide 1 [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastxgi|1892363460.058.15%PREDICTED: similar to dynein, axonemal, heavy polypeptide 1 [Tribolium castaneum]
Group
Gene OntologyGO:00070181.2e-211microtubule-based movement
GO:00302861.2e-211dynein complex
GO:00037771.2e-211microtubule motor activity
GO:00055240.0001ATP binding
GO:00168870.0001ATPase activity
KEGG pathwaytca:6643240.0 
 K10408 (DNAH)maps-> Huntington's disease
InterPro domain[3475-4182] IPR0042731.2e-211Dynein heavy chain
[915-1320] IPR0136021.8e-122Dynein heavy chain, N-terminal domain-2
Orthology groupMCL10001 Multiple-copy universal gene
Genotypes for resequenced monarchs and outgroup Danaus species

Nucleotide sequence:

>DPOGS201656-TA
ATGCACTGCAAAAAGAAAAGGATAAAACGGCAAGATGTAGTCTACGATAACACGGACAGAGACTTGATTCCGAAGCGTGGATATTACTCAGAATTGGTGTCGGACATGACCAAGGAGCATACAGCAAAACAAGTGTTTGCTAAGAAAAGAATGAAGCTTTTGTTACAAGCAAAAACAGATAAACTAGCGCCAATGGTGACGTCATTAGCAAAACCTCAAAAACCTAAGATGTTACTACCCCCAGGAAGGTGGACTACCTATAGTGAGGATGATAGTGTTCAATTTCCGTTTGAAACATTTGTTCCGAAACTGCAATTTCTGAGCGTCGTTTTGCCAAAAGAGCTTCCCAGACTTGTAAAAATTGAAAGACTTCGGAGGAAATTTCTTGCTGCAAATATTAAGAAAATGTTAAGAGAACGTGGCGTCCAACCCTTTGTTTTAATGCCTCCATCCGAATATCCTATTTCGGATGAAGAATGTTATGGTCTATATAGTCCTTATCCAAAAATGGACCTGGAATTATTTGATAATACCGATTTTGATTGTAGAATTCCAGAAGAATGGTTGAGCCTTGGTTTTATAGAAGGCGAACAATATCCCTGTCCAGGGCTAGCCTTTATACCGAAACAAGACGGAAAACCCCATAAACCATCTTCAGATCTTTTGCAAATGCTTAACAATTTGTATGAGTGGACGAACGTGGCCGCGTTTAGCTACGACAAAAATACTGATAAATGGGAAGTAATGGCGTTGGACGGAACGAAGAGATATTTCAACATACCACGGATCCGTCTTATGTTTAAAGCCGATGATCCGGATACATTTGCGGAGAGAGTTAAATTCGCGGTAAATTTGCGGCGAGAAGTAGAGAATAATTTAAGATTTTACCTATATTTGGATTGTCTGCTTCTGGATGGTCTACCGAGGATGCCGTTGAGTTTCATGCCGAAAATAGTATCACTTGTACTTATACACCGGAGCGCTAAAAGCGTTGACAACGATCACTTAAACGCATTAAAACAAGAGGCTGAACTCTTATACAGAAAAATCGAGGGTAAGATGAAAATCATTCACACGATGCAGAAGTACCCGAATTTATACAATTTTATCGATCCTCCGAGCAAGGACTACGTACCTCCTGTTCCAGATTATGGTCGCTATCCATGTGACATGGTAGACTTCAGTGATCGCATGAAGTTCAATCAATGGAAATCTCTTTATGTACTCACGGAGTCAGTCAGTTGTATACATCTGGTTGTAGAGGAGTGCCTTAAGGTGGAGTCTATGTTGTTTTTCACGTCAAACTATGGTAGGAACGTGAGTCTAGCTGAGTTCGATGCAGCACAACAGCATTGCACCTCAATGATGTTGAAATATCTAAACATAACATGGTTAAATGCTACGGCACACGCTATTCGGATGTCGTACAGGGACGTGGGCAAGGGATGGTTTAATATCTACGAAAAGAAATGGGATTTCTACGGAATAAGTAAGCTTAGTAGATTCATGCAATTAGTGAGATTTCGCATGCAGTACGCGCTGCGATACTGTTTGGAGCAATCAATGGCTATGTTCGTAGCCCTTTGTGAGACACCGTGTCTTTGTACGTATTGGTGCCAAGATGATTATGAATGGGACCCAACAGACCTAATAAATACGCCCTTTAGGACCCCTACAACATTATTCTACTTTCATCTAATGATGTCAGTCGACGGACCTTACTATACCACTCCACCAGAACAGTTTGAGATCGTGATCCAACGTCTCTTTAGAGAGATGTTGTACAGATGTCATTTCATACCGCAAGTGCATCCTAAAATAATGACTGGGCTCGTCTTTGATAAGGAGCTCTTCCTTACTTCTATAGGATTAATGGAACCGAACGTCGTCGAATATAGAGACAGGCTGTTGAAGGCTTATAGGAAGGCTATAATTCCCTTAATAGCTTACATGCATCAGTACGACTGCTACAAGGACATATATATGCTGGATATAGAGGAATACGTTGAGAATTTTCGTCAAGAAAAGCATACAGCGTCTGAAACTCGAGAAGAAATTCAAATTCATTACGATGCGAAGCAAGATTTGATTTGGCGTCTGCCACAGTATATTAATATTGGTCCATTCGCTATAAACGTGGATAGTCTAAAGCAAATGTTGGTAACAAAGCGATCAGATATCATAAAGGCGCTACTCATAATGTGGGCAGAGGAAGTCCGTGTTGTTGTTGAAGACGTTATACAAGCATACAAAAACATTATGAGAAAACTTGGCGAGAAGCCAAACACTATTGAACACGTATTTGAAATACGGGAGTGGATGGAATCTATCCCATTTTCATTAAAGACTCAAGATGACATAATGAAGAAAGTGCATACGGATTATGAAGTGCTTGACGTATTTTTCACACCATTAGAGAATGAAGACTTCAGAAGCTTGTGGGAGGCTATAGGGTGGCCTATGAACATTACCAAACAAATGGATGCAACAACAGATTTCCTTGAGGAAGAACAAGAGAAGTTTTGGAAGCTTCATCAACAGGATGAACAGACCTTGTTTGACAAAATTGATATGTTTACCTCACAATGTATGGCGCTGACTTTACAGAACGATTTTGCAAAGATACACGAAATAGCAAACGACATAAAGAAAGCTTGGAAAGGTATGAAGGACTCACAGGAATGGGGAAGAGTTCTCAATCAAAGACAGAAGTTGTTTGGACAGCCAGTTGTACCTTTTGCGGATCTCAATAGATTAGTGAAGGAATTTGAACCATACAGAAATTTGTGGGTCACTGCCTCCGGCAAGTATTTAGCTCGTGAAGTGTGGTTCGATAATCCTCTCATATATGTGGACGCAGATTCAATAGAACCTTTAGTTAACGACTACTACAAAACTATTGTTAAATGTATTCGAGTGTTTGCCGATCTCCCTAAAGTACAGCAAGTGGCTCTAACTATACGGGACGATATGGATGAGTTTAAGCCACTGATACCAGTGATTCAAGCTGTTAGGAATCCTGGAATGAAAGAGAGACATTGGAATGAATTTATGGAAAAAGCTGGTGTAACGGTAACAATGAACGAGAAGCAGACATTCGCGATGTGCCTGAAGCAAGGAGTGGCGCAACATGCTGAACTGATCGCTGAGATTGGTGAGCTAGCTAGCAAGGAGTACGTCATAGAGCAGGCCCTCGATAAAATGCTTAACGACTGGGCCGCCAAGACGATGGAAGTCACTCCATATAAAAACACTGGCACGTTTATAATGAAGATTGCTGACGAAACTCTCCAACTGTTGGATGAGCACCTTTTAACCACACAGCAATTAGGATTCAGTCCTTTTAAAGCAGCTTTCGAGCTTCGTATACAGGAATGGGACGACAAGCTTCGTCTAACACAAAAAGTCGTCGATGAGTGGATTGAATGTCAAAAGGAGTGGATGTATTTAGAACCAATCTTTACATCTGAAGATATATCACGACAATTACCGCTTGAAGCTAAAAAGTATGGCACTATGGAGAGAATATGGAGACGAATTATGTCATCGGCAGCAGCGTGTCCAAAGATTATGATTATATGTCCGGATAGTCGTCTTCTAGACAGTTTGGTTGAAGCTCGCCATTTGCTGGCTGTTGTATCACGAGGTCTGAATGAATACATGGAACTTAAACGAGTACGGTTTCCGAGATTTTTCTTCCTTAGTGATGATGAATTGCTAGAAATATTATCCCAATCTCGCAACCCTAGAGCAGTGCAGCCCCATCTTAGGAAATGCTTTGAGAATATTGCTAAGGTAACATTTGAACCGGATCTAAAGATAACTCAAATGCATTCAAGCGAAGGAGAAATCGTGGATTTGAAGTACAAATTTTATCCGTCTTCAAACGTCGAGCAGTGGCTTCTTCTACTTGAAGACACTATGCGGCATACGATTCGTTTGACCTTGGTGGATTCAATGGTCGAGTTATGGGAGTTACCACGGGATCAGTGGGTGCTCCGTTGGCCGGGGCAGGTTGTGATTGCGGGATCCCAAACAGCTTGGACGGCTGGAGTTGAACAAGCTATCTCAGAATACCGAATGGATGAATACTTTGAGGAGATGCTCAAACAATTGGATAGTCTACGGGCCCTAGTTAAAGGTGAACTAACTTTCTTCCAACGCGAAGTTTTGTGTGCTCTGATTGTTATCGAAGTGCATGCTCGTGACGTCACAAGGACACTGGTTGATGAAAGTGTCAAGAACGTTACTGACTTTCAATGGATATGCCAGTTGAGGTATTACCAGATCGTAAAAGAAATGATACCGCTCGAGGAAGGTGAATTACCGGAGATATATCAAGACGAAGAAACGCTAGACACTTCATTGTACTATCGTCAGTTCAGTCAAAACAAATGTGATGTTCGTGCACTGAATTCGATTTTCACTTATCAAAACGAATACTTAGGGAATAGCGGCCGTCTGGTGATCACACCGCTAACTGATAGATGTTATTTGACGTTGATGTGCGCAATGCACCTCAAATTCGGCGGTGCTCCGGCAGGCCCGGCCGGTACTGGAAAAACTGAGACAACTAAGGATTTAGCCAAAGCATTGGCTGTTCAATGTGTGGTATTCAATTGTTCCGACCAGCTCGATTATATGGCCATGGGAAAGTTTTTCAAAGGACTCGCAGCATCTGGTGCCTGGGCTTGTTTCGATGAGTTTAATAGAATTGACATTGAAGTGTTATCTGTCGTCGCTCAACAAGTCGTGACGATACAAAAGGCGCAAATAGCTCGTCAGGAAAGGTTTATTTTCGAAGGCTGTGAGCTTCCCTTAAAAGCTTCCTGTTCAGTTTTTATCACTATGAACCCTGGATATGCGGGCAGAACTGAGTTACCAGATAATCTGAAAGCATTGTTCCGGCCGATTGCCATGATGGTGCCGGATTACGCTCTTATAGCAGAAATTTCTTTATTTTCATACGGCTTCTACGACGCTAAGATTCTAGCTGGGAA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Protein sequence:

>DPOGS201656-PA
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