MonarchBase - Protein-coding gene

DPOGS202806
Transcript	DPOGS202806-TA	8268 bp
Protein	DPOGS202806-PA	2755 aa
Genomic position	DPSCF300018 - 277819-297146
RNAseq coverage	53x (Rank: top 70%)

Annotation
*Heliconius*	HMEL003763	82.08%
*Bombyx*	BGIBMGA010453-TA	78.93%
*Drosophila*	ds-PA	49.20%
EBI UniRef50	UniRef50_Q17NI8	53.51%	Cadherin n=3 Tax=Culicidae RepID=Q17NI8_AEDAE
NCBI RefSeq	XP_001843793.1	53.58%	cadherin [Culex quinquefasciatus]
NCBI nr blastp	gi\|170031843	53.58%	cadherin [Culex quinquefasciatus]
NCBI nr blastx	gi\|170031843	53.54%	cadherin [Culex quinquefasciatus]

Group
Gene Ontology	GO:0016020	3.4e-37	membrane
	GO:0007156	3.4e-37	homophilic cell adhesion
	GO:0005509	3.4e-37	calcium ion binding
KEGG pathway
InterPro domain	[391-498] IPR002126	3.4e-37	Cadherin
	[387-493] IPR015919	7.6e-37	Cadherin-like
Orthology group	MCL10034		Multiple-copy universal gene

Nucleotide sequence:

>DPOGS202806-TA
ATGTCAGCGATTGATCCTGACTGTGGCGTAAACGCTATTGTCAACTACACTCTGGGAGATTTCTTAGCACGCCAGTTTTCTATCAAGGCTGATTCAGGAGAGCTTTGTGTATCAGCACCACTAGACTATGAGGCAAATTCAGACTATGAGTTCCCTGTTATTGCCAGTGATAGAGGGGGCCTGTCCACGACCGCAATGGTGAAGATTCAACTCCTCGATATAAACGACAATGTTCCGGCCTTCACAGTGAAAGATTACAACGTCTCTCTGAAAGAGGGAAGGATATCTAGCAACGAGCCTATAGTGGCTGTAACAGCCGATGATGCTGATTCAGGCAGATTCGGGACCGTCACGTACAGAATAGTCAACGGGAACGACAATGATGTATTCAGAATAGATAGAAGTACCGGAGAGATATTTATAACAAAACCTTCGTTGATACAAGCCAGTGGAAAGTTTGATTTAGAGATATCAGCAACGGATGGAGGCGGATTAGCAGCACCACAAGGAGCCACCGTCCACGTTAACGTTATTCCCGCTGGAGTTGGTTCAGCATTGTTTGATAAACCCAGATATAATTTCCGCGTGCGAGAAGATGTTAGAAGCGGAACGATCGTTGGAAATCTTAAGGCCACGGCTGGCGGCAAACAACTAGTGCGCTATAGCATTATATCAGGCGATATTGACAATCACTTCACTATAGAAACACATACAGGGGCCATTAGGACTTCAAAGTCATTAGATCGGGAGACAACATCGTCCTACTTATTAAATGTTAGAGCTGCCACAGGAAACCCGCCAAGCTATGACCAGACTCAGGTACAAATTACGTTAGAAGACGTTAATGACAACGTACCGGAATTTGGCACTTCGTCAGTTAGAGTGTCAGTGGCAGAATCAGCACAAATTGGTTCTATTGTGTATGCTGCGAGGGCAACAGACGAAGATGAAGGAAAAAATGGAATGGTCACCTACCAACTGGTGTCAGCCACCGGGCCCGCTAATACTTTTGCTGTGAATTCACAACATGGATTGGTTACGTTGTTAAGATTATTGGATTACGAAAATCTTGTACGTCACACAGTAATAATATCAGCTCAAGACAGTGGGAATCCTCAGCTCAGTGCTAACCTGACTCTTGTCGTTGATGTCCAAGACATTAATGACAACAGTCCAGTTTTCGAGCACGACACTTATACCGCTAATGTCTTAGAATCAGATGCTGTTAAAACTAAGATATTAGAAGTACAAGCTATAGACAAGGATACTGGTAACAATGCTCGCATAACCTATCGCGTGGTATCAGAGAATAATACAAACGAAGAGCATTTCAAAGTCCAGCCTAGTACGGGTTGGGTTTACCTCGCTAAGGCACTCGATAGAGAGTCGATAGCTAAACACAAAATGACAATAATAGCAACAGACAATGGTATCCCACCGCTGTCAACGACTGCAAGCCTTATTGTCAATGTTGTGGATGCTAATGATAATGATCCAGCGTTCTCGCAGGCTTCTTATGAATTTCTCGTTGAGGAAAATCAAAAAGTTGGTGCTTTCGTAGGAAAAATCTCAGCCACTGACGCTGATATAGGGGACAATGCTGTTATTAAATACAGCCTGTTTCCTTCAAATACCAGTTTCGTTGTCAATCCCTCTACAGGTGTTATTACAGCGAAAGAAGTTTTAGATAGAGAATACAAAAATACTTATTTACTTTTTGCTGAAGCAAGAGATCAGGGGACATTGCCCAAGTCGGTTCGTGTTCCAGTGACGATTAAAGTAACAGATGTTAATGACAATTCTCCTGAAATAATAGATCCAAGAGAAGATGTAGTTAGTGTGAGTAGAGTCAAAGCTATAGATAGAGATAACGGTATTAATGCCTCTGTATTATACTCCATTTTAAATGAAAGAGATATGGATGGATTTGGAGTATTCGTTATTGATTCAAATACAGGTGTTATAAAAACAAGCACTGTATTGGACCATGAAGAAAGATCAATTTATCGACTAACTGTAGCAGCAACAGATGGCGGAAATCCACCAAGGCAAACAGTAAGACAGTTAAAAGTTGAAGTTTTGGACTTGAATGATAATCGTCCAACATTTACAAGTTCCAGTTTGACTTTTAAGGTAAGAGAAGATGCAGAAGTCGGTCACGTAGTAGGTAAAGTTGTATGCTGTGATAGCGACATAAACGACAACATTATTAGTAATGATGAAGAAAAACAGATATCATATTTACTTATGCCTCTTACATCTGACCACTTACCCGGCACCTTTGAAATAGACAGAAGAACAGGTTCTTTGGTCGTTGCGAGGAAATTAGACAGAGAAATACAGGATGAATATAGACTCGAAGTGAGAGCTTTAGATACATCGGCTACAAATAATCCTCAAAGTAGTGCTGTAGCAATACGGATCGAAATAGTCGACGTTAATGATAATGCTCCTGAGTGGCACGAGGACCCCATAAACATAGATATATCAGAGATAACAAATATTGGTTCTACTATTTACAATTTTTCCGCAAAGGATGCTGATTCGGGTTCAAATGGAGAATTGAATTTTTATATAATTTCATCACAACCTGTTTCAAATAATGTTTTCAACTTAGATTCCCTTACTGGCACCCTTACTTTAAATTCTCATCTCGATTTTGAGATATTAAAAGAATATTGGTTGGTTGTTGAAGCTACAGACCTTGCAACTAACGTTTCTGAAAGATTAGTAACTTCTGCGACGGTTCATATTTCTGTTCTGGATGCTAATGACAATACTCCTACCTTTGTATCGGCGGATAAAGTATCGGTAACATTAAACACTTTATCCGGAACCCTTTATCAAGCCTTGGCGGTCGATAGTGATTCCGGGGAGAATGGGAGACTATCGTATTACATATCTGGAGGCAACGATTATGCTTATTTTTCTATGGAATATGATACAGGAAAGTTGACTTTGACAAACAAATTTTCTTCTGATATATCAAAGGTGAGGCCAGGAGCCTATAAGCTTAATCTGACAGCATCTGATCATGGGGTCCCTTTCCCAAGGCAAAGCCACATGAGTTTGTTATTAACTCTACAAGAGTCAACGAATGTCCCACCGAGATTTACCGATTCCTATTATAGAGCTAATATCAGTGAAGACATTCGTCCTGGTAGTTTTGTAACAAGACTTTCAGCTAAATCATCTCGAGGAAATACAGGTGCCCTAAATTTCATGATACCATCAAGTATGGCTGGAGATAAATTTTCAATCGACGAACGCCTTGGTACTGTTACTGTTAAAACTAAAATAGACAGAGAAGAAGCGGATCAATACATATTTCCAGTGTATGTTACTGATTCGAGTACTTTTCAATCGACAGCCAATTTTGATGTTGCAACTGTATCTGTGAATGTGTTGGATGTTAATGATAATTCACCGACATTCAAAATTGGCTCTTGTTATACTTTAACTGTACCAGAAAACAATGAACCAGAAGTAATACACACTGTAACAGCTACAGATAAAGATATAGGAGCTAATGGCGTTATCACGTACAGCATCTCATCTGGTAACAATGGAAATAAATTCACAATTGATGCTACAACCGGGAAACTAACAGCCAAAACGTTAGATCGAGAAACGCAGGCAAAATATGATTTAACAATTGTTGCGTATGATCATGGCTCTCCAGTGGCCTTACAAGGAGCTTGCAATTTAACAGTTATGGTAGAAGATCAAAATGACAATGATCCCGTATTTGATACTGGTCATTATTCCGCCACTATTCCTGAAGATGCATCCATCGATACATCTATTATAAAAGTTAGGGCAACAGATGCTGATTTGGGATTCAATAAACGCATTGTCTATTCTCTTGCTAATGAGAGTCAAGGATTATTTAGGATTGACAATAAAAGTGGCGTAATTTATACCACAGGTTATTTTGACCGGGAGAAAACAAGTATTTATCATTTTGAGGCTGTTGCCACCGATCAAGGACGCTATATAGCTAGATCACAAAGAGTTTCGGTAGAAGTAATAATCAACGATGTAAATGATAACAAACCTATATTCACCAAGTATCCTTTTAGAGAACAAATGGCCACATTAACCCCGCCCGGTCAAAGTTTGCTGCGAGTTTCTGCAACTGACAATGATATAGGAATTAATGCTGAAATACTTTATGAACTCTTGGACACATCCAGCAATAAATTTAGGATAAATCCAACTACAGGAATTTTGACTGCTACACAAAGTCTAGCCAGTGAAAATGGTAAACTTATACATCTTAAAGTAATGGCTAAAGATAAAGGAAGTCCACCCCAGAGTTCCGTAGGTCTCATAGAGATTAGGGTTGGAGATTATAATGATCAAAATCCAAGCTTGACCTTTCAAAATAATACATATAACATAACGCTAGAAGAAGGTTCTGCATATGGAAAGGAAATTTTACAAGTAACAGCGTTACGCAGTGACGGTAGGCGTCAAAGGATTATTTATGAATTCGGCAATGGTAATGATCAGTACGAGTTTGAAATTGACTCTAACACTGGTGTCATAAGAGTAAATAATTCAGCTAATCTAGATTATGAATCCTATCCGGGACCAACTAGGAAACTTGTAGTGGTTGCTCGAACAGAAGGTTCTCCTGCCTTATATGGGTACTGCCAAGTAATAGTAAATCTTTTGGATCAAAACGACCACGCGCCAAGATTTACACAGCAACAATATATAGCAAATGTACTTGAAGGAAATACAAAAGGTGAATTTGTGGTACAACTATCAGCAAAAGACGGGGATCGTGGAGCAAATGCTCGAATACTTTATCATATCGTAGATGGAAATCACGATAACGCTTTTATAATTGAACCTGCTTTCTCGAGTTCAGTTAAAACTAACATCGTTTTGGATCGTGAAATCCGCGAGACCTATAAGCTGACTGTCATAGCGACGGATGAAGGAAACCCTCAAATGACCGGTACCGCCACTCTACGTATCAACGTTGTGGA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Protein sequence:

>DPOGS202806-PA
MSAIDPDCGVNAIVNYTLGDFLARQFSIKADSGELCVSAPLDYEANSDYEFPVIASDRGGLSTTAMVKIQLLDINDNVPAFTVKDYNVSLKEGRISSNEPIVAVTADDADSGRFGTVTYRIVNGNDNDVFRIDRSTGEIFITKPSLIQASGKFDLEISATDGGGLAAPQGATVHVNVIPAGVGSALFDKPRYNFRVREDVRSGTIVGNLKATAGGKQLVRYSIISGDIDNHFTIETHTGAIRTSKSLDRETTSSYLLNVRAATGNPPSYDQTQVQITLEDVNDNVPEFGTSSVRVSVAESAQIGSIVYAARATDEDEGKNGMVTYQLVSATGPANTFAVNSQHGLVTLLRLLDYENLVRHTVIISAQDSGNPQLSANLTLVVDVQDINDNSPVFEHDTYTANVLESDAVKTKILEVQAIDKDTGNNARITYRVVSENNTNEEHFKVQPSTGWVYLAKALDRESIAKHKMTIIATDNGIPPLSTTASLIVNVVDANDNDPAFSQASYEFLVEENQKVGAFVGKISATDADIGDNAVIKYSLFPSNTSFVVNPSTGVITAKEVLDREYKNTYLLFAEARDQGTLPKSVRVPVTIKVTDVNDNSPEIIDPREDVVSVSRVKAIDRDNGINASVLYSILNERDMDGFGVFVIDSNTGVIKTSTVLDHEERSIYRLTVAATDGGNPPRQTVRQLKVEVLDLNDNRPTFTSSSLTFKVREDAEVGHVVGKVVCCDSDINDNIISNDEEKQISYLLMPLTSDHLPGTFEIDRRTGSLVVARKLDREIQDEYRLEVRALDTSATNNPQSSAVAIRIEIVDVNDNAPEWHEDPINIDISEITNIGSTIYNFSAKDADSGSNGELNFYIISSQPVSNNVFNLDSLTGTLTLNSHLDFEILKEYWLVVEATDLATNVSERLVTSATVHISVLDANDNTPTFVSADKVSVTLNTLSGTLYQALAVDSDSGENGRLSYYISGGNDYAYFSMEYDTGKLTLTNKFSSDISKVRPGAYKLNLTASDHGVPFPRQSHMSLLLTLQESTNVPPRFTDSYYRANISEDIRPGSFVTRLSAKSSRGNTGALNFMIPSSMAGDKFSIDERLGTVTVKTKIDREEADQYIFPVYVTDSSTFQSTANFDVATVSVNVLDVNDNSPTFKIGSCYTLTVPENNEPEVIHTVTATDKDIGANGVITYSISSGNNGNKFTIDATTGKLTAKTLDRETQAKYDLTIVAYDHGSPVALQGACNLTVMVEDQNDNDPVFDTGHYSATIPEDASIDTSIIKVRATDADLGFNKRIVYSLANESQGLFRIDNKSGVIYTTGYFDREKTSIYHFEAVATDQGRYIARSQRVSVEVIINDVNDNKPIFTKYPFREQMATLTPPGQSLLRVSATDNDIGINAEILYELLDTSSNKFRINPTTGILTATQSLASENGKLIHLKVMAKDKGSPPQSSVGLIEIRVGDYNDQNPSLTFQNNTYNITLEEGSAYGKEILQVTALRSDGRRQRIIYEFGNGNDQYEFEIDSNTGVIRVNNSANLDYESYPGPTRKLVVVARTEGSPALYGYCQVIVNLLDQNDHAPRFTQQQYIANVLEGNTKGEFVVQLSAKDGDRGANARILYHIVDGNHDNAFIIEPAFSSSVKTNIVLDREIRETYKLTVIATDEGNPQMTGTATLRINVVDINDNQPTFPPPNVISVSEGTEVGSVLTSVTANDVDTYPALKYAIVDGDNTFSIDRYSGKIVLNRPLDYENKKVYEVNISASDGEHVARTTLTIKITDINDNTPVFDDITYNRVLPEGSGILEIGCVSAKDIDSEENGKITYSILDPSPGYYIDAETGVLFVNYSALPGSKRDKQIPVIATDHGKPNRSAVASFRISTGASSEIKPFIAQDTYRISVSEDSEKGSTLLQIGGINDILKKYNLDFHIISGNEGDMFDVTSEGTLVLVNRLDRETQDSYIIGLAAVEKGKIMSYSQNKSSITIYVTVTDANDNAPVFSTSDFDLSVSEDVKIGHTLTQLTINDADLYGTPNSAVVFNITSGDDNNLFYIHPTTGSLTVNKSLDYDTGKSKHKLIIVATLNPWGTDCNAVFIKVQILDENDNTPTFPVSEYFETIGENERVGTSVFTARATDLDKGKYGILNYSIEPMSSNYNRNDDSWKMFQIDPVTGLVNTNAVFDYEQKNKYEFSIKASDLGGKSSSVKVRIDVESHDEFYPQFTQKTYNFGVPKSGSLPAGYIIGQATATDKDKGIDGRIVYQLSTSHSYFKINRTTGVIILKKKVDSVQSLFGSDKSISLVITASSGRQGSLTNKTAVEILLDPLAIVSDHPNMVNDTSVSQSSGLSDWALGLLIAFIFIIIIFAAAFLFLHMKNKRHKKVNKPGLNSEGVGATNSYVDPSAFDTIPIRNTGPVTSANQFAPPKYDEIPPYGAHTASSNSGAATTSELSGSDQSGSSGRGSAEDGEDGEDEEIRMINEGPLQRESGIHRQVGGVDDDNLSDVSVHNTQEYLARLGIVDTGTGGGASTSSRRNDNVGNKETMLHHGAIDSMHIFDEDGAHENDITNLIYAKLNEVTGSERASSADETSAAVDRAMALGAFSSAAGENTAVPTAGPSMTGSLSSIVHSEEELTGSYNWDYLLDWGPQYQPLAHVFSEIARLKDDAVSLQSGNSGTSSAKSKGTSISGGKSVPPPLLTTVAPRSCPAPSLSCRQPQHLLPRSPISHDVSGGFSAAAAMSPSFSPSLSPLATRSPSMSPLVGPGLPPAPGSRKPPHSTIRM-

Monarch geneset OGS2.0

Nucleotide sequence:

Protein sequence: