Monarch geneset OGS2.0

DPOGS203958
TranscriptDPOGS203958-TA11064 bp
ProteinDPOGS203958-PA3687 aa
Genomic positionDPSCF300005 + 383822-406599
RNAseq coverage358x (Rank: top 33%)
Annotation
HeliconiusHMEL0135180.054.85% 
BombyxBGIBMGA002018-TA0.072.44% 
DrosophilaLanA-PA0.042.21% 
EBI UniRef50UniRef50_UPI00021A6F010.046.17%UPI00021A6F01 related cluster n=2 Tax=unknown RepID=UPI00021A6F01
NCBI RefSeqXP_001659481.10.044.49%laminin A chain, putative [Aedes aegypti]
NCBI nr blastpgi|3838660570.045.98%PREDICTED: laminin subunit alpha-like [Megachile rotundata]
NCBI nr blastxgi|3838660570.045.86%PREDICTED: laminin subunit alpha-like [Megachile rotundata]
Group
Gene OntologyGO:00310129.8e-23extracellular matrix
GO:00071559.8e-23cell adhesion
GO:00056049.6e-13basement membrane
KEGG pathwaydre:3212430.0 
 K06242 (LAMA5)maps-> Small cell lung cancer
    Pathways in cancer
    Amoebiasis
    Focal adhesion
    ECM-receptor interaction
InterPro domain[15-262] IPR0082111e-137Laminin, N-terminal
[2871-3042] IPR0089852.5e-39Concanavalin A-like lectin/glucanase
[2665-2856] IPR0133207.9e-38Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
[1630-1756] IPR0180312.2e-31Laminin B, subgroup
[3350-3487] IPR0017916.3e-27Laminin G domain
[1635-1769] IPR0000349.8e-23Laminin B type IV
[2904-3024] IPR0126802.4e-20Laminin G, subdomain 2
[530-578] IPR0020492.6e-13EGF-like, laminin
[2562-2690] IPR0103079.6e-13Laminin II
Orthology groupMCL10713 Multiple-copy universal gene
Genotypes for resequenced monarchs and outgroup Danaus species

Nucleotide sequence:

>DPOGS203958-TA
ATGGCGCGTGTTGTCGCGCTTTTTTTATTGTACGTTAGCGTCGCGTGCGCAGAAATATTAAAACCCCCATACTTCAACTTGGCGCTTGGAAAAAGAATTACGGCAACAGCAACATGTGGTGATGAAGGACCGGAATTATATTGCAAACTAGTCGGCGCCAATGCAGATCATGATGAAAGAGTCATCCAAGGACAGGTGTGTGACATGTGCGATGGTACAAACGAAGTCAAGAAGCATCCTCCAGAATTCGCTGTGGACGGCATGGAAACTTGGTGGCAGAGTCCGCCGCTGTCCAGGGGAATGAAGTACAACGAAGTCAATTTGACCATTGATCTCGGACAGGAATTTCATGTGGCCTATGTGTTCGTTCGTATGGGTAACTCTCCGCGACCTGGTCTCTGGGCTCTAGAAAAGTCTACAGACTACGGAAAAACCTTTAAGCCCTGGCAATATTTTTCGGACTCACCGCAGGACTGTGAAAGATATTTTGGCCGAGAAAGTCTCCAGCCTATTACGAAAGATGACTCTGTTATTTGCAGTACTGAATACTCTAAAATCGTTCCTCTTGAAGGAGGAGAAATACCAATATCGTTACTGAACTACCGGCCATCAGCAAACAAATATTTCAATTCATCTGTTCTGCAAGAATGGACTCGAGCTACGAATGTTCGTCTACGTTTGTTAAGAACTAAGAATTTATTGGGTCATCTTATGTCAGTTGCTAGACAAGACCCAACTGTTACAAGAAGGTATTTCTATAGTATTAAGGACATCAGTATTGGAGGTCGATGTATGTGCAACGGACATGCCGATACCTGCGATCCTGCCGAACCCGGCAGCGACACCAGTATTCTCGTCTGCCGCTGCCAACACAACACATGCGGACCTCAATGCGCTGCGTGCTGCCCCGGTTTTGAACAGAAGAAATGGAGAATATCGCAGAACTGGGATAGATTTGCATGTGAACCCTGCAATTGTCACAATCATACCACCGAATGTGAGTACGACGCAGAGATTGACGAAAAACATTTATCGCTTGACATTCATGGTCTGTATGAAGGAGGCGGTGTTTGTAAGAATTGTCAACATAACACGGAAGGAATAAATTGTAACAAATGTAAGCCCACCTTCTACCGACCTTATGGCAAAACCTGGGACGAACTCGATGTATGTCAACCTTGTAATTGCAACTTACATTACTCTACTGGCAATTGTGAGGAAGAGACCGGTCGATGCGAGTGCCGTTCGGAATTCAATCCGCCCAATTGCGATTCTTGCGCCTACGGTTACTTCGATTACCCAAACTGCAAGCCTTGTACTTGCAATCTTAATGGTACTGAGGGTCAACATTGTACGCCAACTGACGGAATGTGTCCTTGTAAATACAACTACGCTGGCAAATCATGTGAAATGTGTGCAGATGGATATTATTCTCCTGAATGTAAAAATTGTGAATGTAATTCCGTTGGATCTGTATCCCAAGTGTGTGACAAAGAATCCGGTAACTGCACGTGTAAAAGTAAATATAGTGGTCGCACATGCAATCAATGTGAAGCCGGGTACTACGAATATCCAACCTGCAAGCAATGTAACTGTGACGTAAGTGGTACTGAGCCAAATGTATGCGATGACGTTACTGGCCAATGTGTCTGTAAACCAGGTTTTGGTGGTGTTCGCTGCGATCAATGTTTATCTGGATACTTCATGGAAGTTAAAGGACGCGAACGTTCTTGCGTACCCTGTAACTGTTCTCCGACAGGTTCAACTTCAACAAGTTGCTCCGCCGATGGCAAATGCAACTGTTTAGTCAACTTTGGTGGAAAACAATGTGACCAATGCTCTCCTGGATATTATAAATTCCCAGAATGCCTACCATGTAATTGTGACGAATCTGGTACATTTGGTTCCACTTGTGACGATAGCGGTCAATGTCATTGCAAACCTAACTTTGATGGAATCAAGTGTGATAAGTGTAAAGAACAATTCTACAACTTCCCGGCTTGCGAAGAATGCAACTGTGACCCTCGAGGTGTCATAGCTTCTTTTGCAGGCTGTGGATCAGTACCCGCTGGAGAGCTCTGTCAATGCAAAGACCGAGTACAAGGAAGAATTTGCAATGACTGCAAACCATTGTTCTGGAATCTTCAAGAATATAATCCTTCGGGATGTCAAGAATGCAGCTGTAACTTGGCTGGAACCCTTGGTGGCCTTGGTGCTTGCAACACACGTAGTGGCCAGTGTACCTGCAAAATGAATGTTGGCGAAAGACAATGTGATGAATGTCAAGATGGATTTTATAAATTGGAATCTCAAAATCTATTTGGTTGTGCTGCTTGTGATTGCGATATTGGCGGTTCTATTGACAACAACTGCGATAAGCGTACCGGACAATGTCGTTGTCATTCGCGGGTAGAAGGCCGCCGCTGCGACCGACCTATCCGAGCTCATTACTTCCCCACACTGCATCAGTTCCAATACGAGGTGGAAGAAGGTCTTACTCAATCTGGACCTGTCAGATACAGAAATTCAGAGGATGTTTTTCCCGGATACTCATGGAAGGGTTATGTCGTTTTCTCACTTTTGCAGAACGAGGTAATAAATGTGGTGCATATCGGAAAATCTTCATTATTCCGTATGGTCTTAAAATATGCAAACCCTCTACGAGATCCTGTTACTGCTACCATTATTGTCACACCGGAAAGTGTTATTGATACAAAACAAGGGTTTAATGTACAATTAAGGCCTACTACGCAACCACAATTAGTAACAGTTTTAGTTGAGAAGGGTATTGCTCCAGCTCCATTTGTTATGAATGCTGGAACCTGGACTGTCACAATTAAAACCACTAAGGAAGTTATGATTGATTACTTCGTGCTTATACCTGAAGCTTACTACGAGGCTACTGTTTTGACTAAGCTTGTTGATAAACCATGTATTATTGGTGAAAAGAAACTTTGCAGACATTTTGCTTATCCCAGCCTCAGCGGGTTTCCAACTGCTAATGTATCTGATATGGTATCTGACGTTACTGACTTTATAAACGATCCTGAGCAACTGCAAGAACACAATGCTGGTCCTAATGATATACCAATTATCAACAATGAACAAAATGAAATTGAGTACAATATCAAAATTGATCCTAGCGGCGCCTATGTTATAATCATTGAATACATTACTCCAATAAATAGAACAGCCTTAGCAGCAAGTGAAATAAATTCCGATCAAGGTGGAATGTATGATTTAGCTCCAAGAGGTGCAGTTGCCATAAGATTTCAATCTGGAGATGGTCCTGAAACTATTGCTTTCGCCAACCTCAATGACTGTCCATATACAGCACCATGTAGGCAAGTGGTCGTTGATGATTTATCAAAGATCTCAGTTTTTAATGTGCAGGAACCAAATAATGTAATTTATTTAGATGGAGATACTGATACTTTGGCCGCCATCAAATCAATTATCGTGATCCCAGAATCTCAATGGCATCTCGACTACATCACGCCACGACCATATTGCTTAAGACGAAACGGACGCTGCAGTCCGGCTGTTTTTTCAACTGCAGTAGATTCCAAAAAGGTTGAAATAGAAAGCGGTACTGGAGGAGATCGCGAGAGACGTCCACCAATCTTAGATAACTCAACCATGGTTGTTTATTTAGTACCTCAATCAGATCCAGTGAAAATTGAATCCAAAGTTCCTTCTCCCGGAGATTATATATTCGTTATACATTATTACCAACCAGATAACCCAGAATCCAATATTAATATAAACATAACAACTGACGGGCAGCAACGCGATGCCACTCTTCCCATAGAACATTGTCCTTCTAATTCTGGATGTAGAGCAATAATAATCCAAGCTGGTGGTAATAAGCAATATGCAGTAAATGAAAATTTCACCATAACATTCCAGGGGAACACTAGTAAAGGAGTTTGGTTAGACTATGTGCTCGTCATAGCTAAATCAGATTTTATTGACTCAGCCCTAAAAGAAAATAATATGGTAGATTATACAAGAGAATTTATTGAAAAATGTGCTCTAAATCATTACCACATTAGTTCAAATGAAACAGGTTTTTGTCACGATGCAATGTTTTCAATAACGTCAGAATACAACAGCGGTGCATTAAGTTGCTTCTGTGACTTTATGGGATCTACAGAATTAGAATGTAACACTTTCGGAGGCCAATGTCCCTGCAAAGAGAACGTAATTGGTAGAACATGTAGTGCTTGTAAAACTGGATACTACGGTTTCCCTAATTGCAGACCATGTCATTGTCCTTCTACCGCCATTTGTGACGACAATGGAGAATGTATTTGTCCCAAGAACGTGGAAGGAGAGAACTGCGATCGTTGCAAGCCATATACATTTAACTTTGACGTGCAGCGCGGCTGTGATGATTGCAATTGCAACCCGATGGGAGTCATAAACGATCAGCTTCAATGTGAGGCTGACAGCGGAAACTGTCCATGCAAAGACAACATTATTGGACGAACTTGTGATCACTGTGAACCGGGACATTATGATTTTCCCGATTGTGTTCAATGTAGCTGTGATCTTAATGGTACTACTGATGATGTATGTGATCAAAATACTGCCCAATGTTATTGTAAGAAGCATGTAAAAGGCCAAGCGTGTGACGTCTGCAAAGAAGAATATTTTAATCTTCAGTCAGACAATCCCGAAGGATGTACGAAATGTTATTGCTTTGGGAAAACTACAAGATGCAGCAGCTCTCACCTTTCATGGGCTGAGCTCAATGGAATGTCAGACTGGTATCTAGCAAATATTGAAGCTAATCGTACCCTGAGCATATTTCGTCTAGGCATTGATCCTACTTTATTTAATGACTCTGTAATTAGTGCTGATCTATCGGGTAGCGAGGAAGATTCACAAAAAGTTGTTTACTTTGGTGCCCCAGACTATTATCTGGGAAAACGTCTCAATTCGTATGGCGGATATCTTACCTATTCCATTTTCTATACAACCCGTGATGATGGGAG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Protein sequence:

>DPOGS203958-PA
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