Monarch geneset OGS2.0

DPOGS207300
TranscriptDPOGS207300-TA10323 bp
ProteinDPOGS207300-PA3440 aa
Genomic positionDPSCF300008 + 802855-813780
RNAseq coverage108x (Rank: top 60%)
Annotation
HeliconiusHMEL0220156e-4024.26% 
BombyxBGIBMGA014545-TA0.044.52% 
DrosophilaCG42255-PA0.028.39% 
EBI UniRef50UniRef50_UPI000175817A0.032.17%UPI000175817A related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI000175817A
NCBI RefSeqXP_967977.20.032.17%PREDICTED: C3PO protein [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastpgi|3320204770.033.37%Cubilin [Acromyrmex echinatior]
NCBI nr blastxgi|3320204770.033.31%Cubilin [Acromyrmex echinatior]
Group
Gene OntologyGO:00055092.2e-13calcium ion binding
GO:00055154.4e-07protein binding
KEGG pathway 
InterPro domain[743-859] IPR0008591.1e-39CUB
[78-119] IPR0018812.2e-13EGF-like calcium-binding
[78-114] IPR0130912e-07EGF calcium-binding
[352-384] IPR0062094.4e-07EGF
[81-119] IPR0062105e-07Epidermal growth factor-like
Orthology groupMCL10881 Multiple-copy universal gene
Genotypes for resequenced monarchs and outgroup Danaus species

Nucleotide sequence:

>DPOGS207300-TA
ATGGAAAAACGAAATGATTTTCAAAATAATGTGCAACTTAATATTACCTATTTGACACGGAGATTTAATAATTTGAAGAATAGAATACGAGCTTTGGAGCTATCGGTAAATAATAAAAATAAAGACCAATGTCAATCACATCCGTGTGAAAATGGCGGAACTTGTCTAAATCTAGCAAATGGTTTTTACTGTTTGTGTCCATCAAACTGGAAAGGCGCTAGTTGTAATGAAGATGTAAACGAATGTCGTAATTACGCAGGAACTGACTTAGGTTGTCAGAATGGAGCGACTTGTATCAACAAACCGGGATCATATGAGTGTCTGTGTAGACCCGGCTGGTATGGACTGGATTGTACGAGAAAAGCTAAAGATTGCACCGGTGGGGACTATGAAATGTGCGGCCATGGGACGTGTGTTTCTGTTACAACGGGAGAAGGTATCAAGTGTTTTTGTAATCAAGGTTGGACTACAAACGGAACTAGTGTTGCTTGCCTCACTGATGTCGATGAGTGCTCGTCCGGTCAAACGCCACGTTGTTCAGCAAATCCAAAAGTAGAATGTATAAATTTGCCTGGTTCATTTAAATGTGGACAGTGTCCAGTTGGTTATGAAGGCGATGGGTATGTCTGTCATGATGTTGACGAATGTCTTACATTAAACGGTGGTTGTAGTACAAATCCTATGGTGACTTGTCACAATACCATTGGGTCACGGATTTGTGGTTCATGTCCCCCTGGCTTTCAAGGAGATGGTGTTACATGCGTTTGGAGAGGTTCATGTGCAATTAATCGTGGTGGTTGTCATCCGTCTGCCCAGTGCATTGAACATCCCATGTCGAGTTCTCAAATTGCACAATGTGTATGTCCTTATGGAATGGAAGGCGATGGCGTTGGTCTACGAGGGTGCTTTATTAAAACAAATGATAATAGTACGCAAAATTGTGGAAGCAATCCATGTGGCGAACACGGCCACTGCCATGAACTGAATGAAGGTTATACCTGCATATGTTTGCAAGGGTATGCCGGAGCTCATTGCGAGAGGTTGAGTAATTTGTGTTCCAGTAATCCATGTCAAAATGGTGGAACTTGTAGACCAGATGAAAAAATATCTAGAGGATATAGATGCGAGTGTTCTGCTTTATATTCAGGAATACTGTGTCAAATTCACTCCCAACCATGTGGTGGAGTTCTTGATTCTGAAGAAGGTAGTATCGTATATCCTTTAACAAATACAACCTATAAGCATAACGCCCGATGTGCATGGGTAATACACACCTTACCCGATAAAGTTATAAATGTTACTTTTAGTAAATTTGATATAGAAGCGGATTCGGAATGTTATTTTGATTTTGTACAAATTCACGATGGACGAAGCTCAGCTAATCAGCTTATTGGCCGCTTTTGTGGAAATACTTTTCCAAACGGTGGCAATATAATATCGAGTCATAACAATTTATACTTTTGGTTTAGATCAGATCATTCTGTAGCAAAAGAAGGGTTTGCTTTACATTGGACCAGTATACCACCTGTCTGTGGGGGGGAAGTAGATGCTAGTAAGCATGGTAGAATAAGTTCGCCTGGATCACCTGGTAAATACCCCCCTAATCGAGATTGCTATTGGCATTTATCTACAACTCTGGGCAAAAGAATTCAATTACATTTTTTCCAACTTGACATTGAAGTGCATGCTAATTGCAGTTTTGATTATATAGCGATATATGATGGTGAAAGTACAAGTGATCCACTTATTAATAAATATTGTAATTCGAGCCAACCAGAACCGATACAGTCATCTAGTTCTGAAATGCTCATACATTTTCATTCAGACGCTACTAGCAATGGTTATGGCTTCCAAATAGTTTACGCCCCTATTGAAGGAGTTCCTGGTTGTGGCGGTTTCTATACAACGGATAGAGGAGAAATAGTTTCACCTTCTTTTGATGGAGCCTATTTAAACAATTTATTGTGCGAATACAGAATTAAGACAAGACAGGATACAAAAATTAAACTTACATTTACAACTTTTAGCTTAGAAAAATCGTCTTCGTGTAGATACGACTTTTTGAAAGTATTTGACGGTTCATCATTGGAGGCTCCACTCGTTGGAAAATTTTGTGGTAACATATATCCAAAAACGTACACATCTACTACAAATGAGTTATTCCTTTTATTCAAAAGTGATATAACTACGTCTTCTGGAGGATTTAAAATTAAATATGAAGCACTTTGCGGAAAGACAATTGTTGGGGATAGTGGAATAATAAAGTCTCCCGGATATCCATTTAGTTACCCTAAGCAGACTGTTTGCGAATATTTTATTAATACCACTCCGGGAAAAGCGATAGTTTTAACATTTCAAGACTTTGACATTGAAGATAATCGATATTATCATTGCCTATATGACCATGTTGAAATACGGGACGGGCCTACTGTCAATTCTACTCTACTTGGGAAATATTGTGGAGGAGGGGAATCGACGCCGCCTATACAAACATCAACATATAATTACATGTATATAAAATTTAATTCAGATATGAGTATAACCGGCAGAGGTTTTTATGCTAATTATACCACAATAAATATAAAATGTGGAGGTATCTATAAAGAAGCTACTGGTATTATAAATTATCCTGTAGATGAAAATCTTTCGTACACTGTTAATCAATCATGTACCTGGATAGTAGTTGCCCCTGAAGGAATGCACATTAAATTGAGCTGGAATAGATTCGATCTCGAAGATATGGTTGACTGTAACAGTGATTATGTGGAACTCATTGAGTTAGATAACAATAACGATGAAAACATATTAGGTAGATACTGTGGCGATACGCTCCCTCCGGCCTTAACAACTTCATCAAATCGTCTTCGAATTAATTTTATTTCCGATAGTACAGTTTCTGGAACCGGCTTTTCAGTTTCATACTCATTAATAGACGAAAAAACTCATTGTGGTGGACTATACGTTAAATCTCATGGTTTTATATATTCGCCAGGTTGGCCTCATAGTTATGAATCTAATCGTGACTGTACTTGGAAAATAAGTGTACCGAAGGGCCAGCAAATTTTTATTAATATTACCGATTTTGATTTAGAACGACCTATTCGGGACAACTGTGATTTAGGGGATTATCTTCTAATAAGAGACGGATCTTCTGAACAATCTCCATTAATTGCTAAAATTTGTGGTTATTATAAATCTAAACGCGTTGTTTCAACTGCTAATAACATTTATATTCATTTTCACTCTGATTTTTATTTATCTGGCAAAGGTTTTAAAATCGAATGGGATGGCACAATCCTTGGTTGTGGAGGCACATTGACTAGTATCCAAGGTATGATAGCTTCTCCTAATTATCCACAAAATTACAACGAAAATTCAGAGTGTTTTTATCGTATTGTTACCAGTAGTGGTTCACGTATTGCAATTAGTTTTAGCGATTTAGATCTAGAACATAGTGAACGCTGTACAGACGATTACCTAGAAATATTCGACGGTCGAGATAGTAATTCACATAGTTTTGGAAGATTCTGCCAAAAAATAACTCCTTTAAACGATATTATGACCAGTCACAACTATGCTTTTATAAAGTTTAGATCCGATATTTTAATAACAAAAAAAGGCTTTTTATTAAATTATCATACTATATGCAATAACAATGTCAGTGGCCCCTATGGTGTGATTGAAAGTCCAGGATATCCTAATAAGTATCCAATAAACTCTAATTGTCTTTGGACAATCACGGTGCCAAAAGGAAATAAAATAAATATCACCTTTACGAATTTTGATTTATTCAGTCCAATTTCTAGACCTTTCTACAGAATTTTTCGACCGTATAATAGAATACGTAGTACTGATCCATGCAGCGCGGATTATCTTCAAGTAAAAGAGACATCAGAAGAAAAATTCGGTCCAAAATTATGTGGGACTATTATGCCGCGGCTTATTACTTCCGAAAAGAATTCTGTGCAGATTAAGTTTGTATCTACATCACCCTTTCCCCACAAAGGATTTCGTTTGGAATGGTTGAGTTTTGGCTGCGGTGGATATATTCAGAAAGCTTCAGGTTCGTTGTTATTTGATAGAGCATTAAGTTCTTCGGGAGAAATAGAATGCGAATGGACTATAGAAACACCATTGGGAACAGCAGTCTCAATATCATTTTCAGAGTTTTATATGCTAGAATCACGAAATTGCACCGATGACGCCATTGAGAATTGCACCTGGACTATTCTTGCACCGAAAAACAGTGAAAAGGTAAAATTAACGATAAAGCATATATCTTTATCAAAAAATTCTGATATTGTGACAAACAGAAATTGTCCATCATCATATTTAAGAGTGTTTGATGGTAATGATGACAAAGCGCCATTAATAGATGAGTTCTGTGGTAGCAAAGTGCCTCCAACAATTGTTAGTCGTGGTTCAGCACTCACAGTACAGCTTGGTACATATACCGATATGATTAATGGAAAGTTTTTGGCACACTATTCTTCTTTGGAAACATCGTGTGGAGCTGAATTGACATCAGAAGAAGGATCGGTTGCCTCTCCCAACTATCCCTTATCATACCCAACTAATGCCGACTGTGAATGGACTTTAAGTACCTCACCTGGAAATAAGGTATATATTACATTTGAAACATTTGACTTAGTTTATTCTGAAAATTGTAATGAAGACTACTTAGAAATACGAGAAAATAATGGCGGAGGTGAACTCTTAGCAGTTTACTGTGGCAACGAAATCCCATCAAATACGACGACGGGAACAAAACTTTATATTAAATTTCATAGTAGTAATAAAAGCCCTTCTAGAGGATTTCTTCTCCACTATGGGTTCCTTCATGGCAATGAAATTACCGGAAAACAAAGTGGCCAAATTAGTTCACCATTTTATCCTTTGCAATATGAAGGAAGTGGTGAATTTTCTTGGCGTATTTTAACGGAGGGGTCTACTACAATTTCTATAGTAATTGATGACTTAGAAATACCGAGGCATAACGA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Protein sequence:

>DPOGS207300-PA
MEKRNDFQNNVQLNITYLTRRFNNLKNRIRALELSVNNKNKDQCQSHPCENGGTCLNLANGFYCLCPSNWKGASCNEDVNECRNYAGTDLGCQNGATCINKPGSYECLCRPGWYGLDCTRKAKDCTGGDYEMCGHGTCVSVTTGEGIKCFCNQGWTTNGTSVACLTDVDECSSGQTPRCSANPKVECINLPGSFKCGQCPVGYEGDGYVCHDVDECLTLNGGCSTNPMVTCHNTIGSRICGSCPPGFQGDGVTCVWRGSCAINRGGCHPSAQCIEHPMSSSQIAQCVCPYGMEGDGVGLRGCFIKTNDNSTQNCGSNPCGEHGHCHELNEGYTCICLQGYAGAHCERLSNLCSSNPCQNGGTCRPDEKISRGYRCECSALYSGILCQIHSQPCGGVLDSEEGSIVYPLTNTTYKHNARCAWVIHTLPDKVINVTFSKFDIEADSECYFDFVQIHDGRSSANQLIGRFCGNTFPNGGNIISSHNNLYFWFRSDHSVAKEGFALHWTSIPPVCGGEVDASKHGRISSPGSPGKYPPNRDCYWHLSTTLGKRIQLHFFQLDIEVHANCSFDYIAIYDGESTSDPLINKYCNSSQPEPIQSSSSEMLIHFHSDATSNGYGFQIVYAPIEGVPGCGGFYTTDRGEIVSPSFDGAYLNNLLCEYRIKTRQDTKIKLTFTTFSLEKSSSCRYDFLKVFDGSSLEAPLVGKFCGNIYPKTYTSTTNELFLLFKSDITTSSGGFKIKYEALCGKTIVGDSGIIKSPGYPFSYPKQTVCEYFINTTPGKAIVLTFQDFDIEDNRYYHCLYDHVEIRDGPTVNSTLLGKYCGGGESTPPIQTSTYNYMYIKFNSDMSITGRGFYANYTTINIKCGGIYKEATGIINYPVDENLSYTVNQSCTWIVVAPEGMHIKLSWNRFDLEDMVDCNSDYVELIELDNNNDENILGRYCGDTLPPALTTSSNRLRINFISDSTVSGTGFSVSYSLIDEKTHCGGLYVKSHGFIYSPGWPHSYESNRDCTWKISVPKGQQIFINITDFDLERPIRDNCDLGDYLLIRDGSSEQSPLIAKICGYYKSKRVVSTANNIYIHFHSDFYLSGKGFKIEWDGTILGCGGTLTSIQGMIASPNYPQNYNENSECFYRIVTSSGSRIAISFSDLDLEHSERCTDDYLEIFDGRDSNSHSFGRFCQKITPLNDIMTSHNYAFIKFRSDILITKKGFLLNYHTICNNNVSGPYGVIESPGYPNKYPINSNCLWTITVPKGNKINITFTNFDLFSPISRPFYRIFRPYNRIRSTDPCSADYLQVKETSEEKFGPKLCGTIMPRLITSEKNSVQIKFVSTSPFPHKGFRLEWLSFGCGGYIQKASGSLLFDRALSSSGEIECEWTIETPLGTAVSISFSEFYMLESRNCTDDAIENCTWTILAPKNSEKVKLTIKHISLSKNSDIVTNRNCPSSYLRVFDGNDDKAPLIDEFCGSKVPPTIVSRGSALTVQLGTYTDMINGKFLAHYSSLETSCGAELTSEEGSVASPNYPLSYPTNADCEWTLSTSPGNKVYITFETFDLVYSENCNEDYLEIRENNGGGELLAVYCGNEIPSNTTTGTKLYIKFHSSNKSPSRGFLLHYGFLHGNEITGKQSGQISSPFYPLQYEGSGEFSWRILTEGSTTISIVIDDLEIPRHNDKCSSELRIYDGYDDEAPLLSELCGVYKNENRNLQTTSNVVYIKLVLDSSSIGSLFHIRWAQSARSIPDSTSHNKINCGLNQTKTVTPQSNFIFNSPNFPNPYDSDLNCEWIFKTTPGHHLTLSFKEIDLEQTPSCFADYLSIYSSKNGLQWQPIHENVCLSDFETNKMNSLSYLKVIFKSDGYSSRKGFQAIVKSECGGTIENPSGIVEVTSLDYGTIQNNHNYKLKCNWTVKVRPGRTIKANFLNFHINNSNECNTYVLLRNGESVESPILGKYCGYSHENMSDIISSSNAIHITYNTVKTIVGSKGVSQTFKLQYEELNVECGGTSILDSDHSWETINSPNYPSIPVPYTECIWIFTGPPGEILRIDFMDRFDLESSNQCQFELVEIRDGSSELSLSKGRFCKDPGTIKTTSNTMFIRYSTQTPEPRNGFKANVTIDVCGGTIVAEKGQLTSPGYPHMLILSPGSVCQWTIISKERHVILLEFKDFDLPESEKPCQTKVSIEEPISYNGTASVGLRNICNDGTYESINPIETLSNKVIVKLHMGKPSPWTYTGESRGFKLTFNSSRPSCGGSITASEGFITTPGYPIETSLLYCQWDITTPNINRRIRLELLDFDPNHNLGILNDLSFTHSLGGYFDEKNLSTAAPVFESTGNRLSFYVWMGPISKTKHRFKARFSSDEPSLCGGRLSGIQGHLTFPNLDRSYDCSWKYNDFLQSLTNSTSFGSIYLSINMSSSAGAICRYSDSKLNIISNVLDSRTLGSLFIRNICGKHSQLTYRIPALNMDIKATQYARNPITFDLDWKLQPCGGLIHAVETSNNVLNIPLSHKDDINCAWILKSPSGIRISLKLEGTFNLDCSDEYLQIREGITETSPVIGDYCKNKMQESPLVTAFSHLYIQYYSKPQNNTNFKLIPTIITYICGGLLTQFDRVFSSPNYPKSYRENQECVWEIEAETGYRVSLQFIDRFVIEDTTNCTKDAIIIYDWIENEYKEMSRLCGRLLPPKFNSTYNKMKVVFRTDASINLEGFKAQWTSICGGRLEAKPKEGFLYSPGYPNKYYPSLNCQYEIVAPSEKIIIQFLDFELEGSYPECEYDNITMEHQSDNNYFYGVYCGKEKPAPLQIYDSVKVSFKTDLFGQRKGFKMSYSLYNCGGIVREPTTLTSGMSDNYGDNSNCTWLIEAPKGKLVVVNILYIDLESSYECYSDYIAVYNGAQINSSKRIALLCGHVNTTTILKSNENSMVFQFISDSYLNYRGFKAEVLFTYSEAVGCGGMINLNTSRQHILKTPLFNNSPVYENYLECHWTIKAPIDKVIKVEFTSFHVAPCANVNQTELGYDKCDCDILEFRDGLNPTSLLIGKYCGHSMPPQIFSSRNVLSIRFSTDGDIQSSGFEIMLTSEPSVCGQSVYTVSNKMQRVKSPGYDKGLIPRGIHCNYFFDTGSSFSSVHIRINNLDIEASNENAECDKDKIIITGETQHPNVTFGKDLIIASPNDNIFVSAYLFESTLAFPKEIVLCGSKKSLDYYITSNINIHLQTSAGTTAVHRGVELEVSFAGFCGRNYTELQGRIIRTTEIDSDADTDCYTLITVPENYTITIYFISISPAYTNDNVYLDIIDGKDKSSPLLYKITMDYPDVTQMFTTGRYLLLHNHMADQEAVNFDLIYVATNKGRGCGGYIHNEIGRVTSPLHPDTYRRKATCEWELETPSNTRLYLHFTEFDLGRACEQNYLRLVDKEGNTISSFCEETPADYTSPNNYVKIVFTTTMNNGGTGWAANFVGII-