Monarch geneset OGS2.0

DPOGS208460
TranscriptDPOGS208460-TA9543 bp
ProteinDPOGS208460-PA3180 aa
Genomic positionDPSCF300064 - 1705031-1719072
RNAseq coverage68x (Rank: top 67%)
Annotation
HeliconiusHMEL0080570.082.17% 
BombyxBGIBMGA010599-TA0.083.01% 
Drosophilaft-PA0.055.02% 
EBI UniRef50UniRef50_UPI0002247D150.055.84%UPI0002247D15 related cluster n=1 Tax=unknown RepID=UPI0002247D15
NCBI RefSeqXP_971084.20.062.16%PREDICTED: similar to AGAP007924-PA [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastpgi|2700064230.062.17%cadherin-like protein [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastxgi|2700064230.062.19%cadherin-like protein [Tribolium castaneum]
Group
Gene OntologyGO:00160209.7e-39membrane
GO:00055099.7e-39calcium ion binding
GO:00071563.9e-36homophilic cell adhesion
GO:00055151.5e-06protein binding
KEGG pathway 
InterPro domain[15-119] IPR0159199.7e-39Cadherin-like
[13-123] IPR0021263.9e-36Cadherin
[2159-2385] IPR0089855.3e-36Concanavalin A-like lectin/glucanase
[2178-2399] IPR0133201.4e-27Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup
[2208-2360] IPR0126791e-22Laminin G, subdomain 1
[2200-2358] IPR0017917.3e-19Laminin G domain
[2476-2598] IPR0126805.7e-16Laminin G, subdomain 2
[2107-2142] IPR0062101.5e-06Epidermal growth factor-like
[2108-2138] IPR0062095.2e-06EGF
Orthology groupMCL10034 Multiple-copy universal gene
Genotypes for resequenced monarchs and outgroup Danaus species

Nucleotide sequence:

>DPOGS208460-TA
ATGCAGTTTACAGATGTCACTATTGTTGTTCAGGTCACCGATACGAATGACAATCCACCGATGTTCAAAGAGAGTGCTTACTCCTTTGACATACCAGAAAACGCAGCCCGGGGTTCCGTGGTTGGTACAGTGGCGGCTATTGACCTCGACTCCGGACCAAATGCTCAACTCACCTATAACGTCATATCGGATTGGGCTAACGATGTTTTCTCACTCAACCCGCAAACAGGAATTTTTACGTTGACAGCGCGCCTCGACTATGAAGAGACTCAACATTATATAATAGTTGCGCAGGCGCAAGATAATGGACATCCTTCTCTTTCTGGTACAGTGACGGTTTACATAAACGTTATTGACTTAAATGACAATGCGCCTGTCTTTGATCCAATGAGTTTCTCGAACGAAATTCTTGAAGATGTCCCAGTTGGATCATCTGTGGTGACTGTTAGCGCTACTGACATCGATTCAGGTTTTAACGGGAAATTAACATATAGTATTTTTTCGGGGGATGATAACCAGGATTTCAAAATATCTTCAAATGGTACGATCTTTACATCAAGTTTATTAGACAGAGAAACTATACCAATATACAATTTAGTAATTACTGCTAAGGACTTAGCAAAGCCACCCGAACCTCGGCTATCGGCTACAGTGCAGGTTACAATACTCCTAAAAGATGTAAATGATATGGCCCCTGAATTTATTTCTCCAAAAACCACTGCAATATCTGAGAATATTCCATTAAATACTGTAATAATGACTGTAAAAGCTGTTGATAAAGATGAAGGTAGAAATGGGTATGTTGAATATTTTATGGCGCCAGATCCTGAAGTGGATGGTTATTTCACATTAGGAAATGTTGATGGTATATTAAGAGCAACGGGAAAACTTGATCGAGAGCTAAAGTCTAATTTTACAATACTTCTGACTGCAAAGGATCGGGGAGACCCACCCAATGTTACAAAAGGCAAAATTTTTATAAAAATATTGGATGAAAATGACAATAGTCCTGTGTTTGATCCAAAACAATACAGTGCTTCCGTGCCTGAAAATGCAAGTATAGGAGCAAGTGTGTTACAAGTATCTGCAACAGATGTCGATGAGGGTATTAATGGTAGAGTAAGATATTCCATTGCATCCGGAGATGAAAATAGAGATTTTAGTATCAGCGAGGATACTGGAATTGTTAGAGTAGCTAAAAATCTAAATTTTGAAAGGAAATCTCGTTATATTTTATCAATAAAAGCTGAAGACTGTGGCAAAGACGATATAAGGTTCGACACTGCGGAATTATCTATATCTATTCAAGATATAAACGATAACCCACCAACCTTTCTTGATACCCCATATTTGGCTTATGTTATGGAAAATGTAATTCCACCTTACGGAGGATATATTCTAACAGTACAAGCATATGATGCAGACTCACCTCCATTCAACAACCAAGTGAGATACTTTATAAAGGAGGGTGATTCAGATCTCTTCAAAATAAATGCATCTTCGGGACAAATATCTTTATTACGGACTTTAGATCGTGAAGCTCAAGATGAATATACACTTTCTCTTGTAGCTATGGACACAGGTTCTCCCCCACTCACTGGTTCTGGAACGGTCAAAATTATTGTACAAGATGTTAACGACAACAGTCCAGACTTTCAGAGGCAAAGTTATAAAACCAGTGTTAAGGAAAACTTACCACCAGAAACTGAAATACTTCATCCCAAAGCAATAGATAAAGATATAGGTAATAATGCAAAAATAAGATACAGTTTATTAGGTGATAAATCAGAAAGATTTAGAATAGATCCAGTAACTGGTGTTGTTTATACAAATGCAACATTGGACAGGGAAGAGTGGGAAGTCTACTATCTTATAATAATGGCACAAGACTCTTCTACTACAGACCCAAGAACAGCTACCGCGAACCTTACAATTATAGTTGAAGACGAAAATGACAACACACCAACATTTCCTCAATCACTTTATGAGGTTTATATATCTGAGAGAACCGTGCAAGGTGATTTTGTTTTTGGCGTGAAAGCGAAAGATAATGACATTGGAGATAATAAAAAAATTGTATATGATATAAAGGGAGAACATCATAGCCTTTTTACCATCAATAAGGATACAGGAGTAATAAAAGCAAAAGAAAATTTAATGAAATACAAGGATAAAATGAGATCGACTTTTAATCTTATAATTCTAGCAACTGATAGTGGAACTTTTCCTAGAGAAAGTTCCGCAGAATTGATTTTAATACCAAAATCAGGAAAGAATTTTCCAAAATTTACCGTGAATAACAAATTGACCTTTTCATTTTCTGAAGATACTCCAGAAGGTGTATTAGTAACTAGACTTTCAGCAACATCGCCAAAAATTGGTCCTACTGGACTCCTTCAATATTCAGTAGCGGGAGGAAATGTAGGTGATGCCTTAAGGGTTGAGCCAATGAGTGGTGAAATTTTTATCACTGGTAGAGGCTTTGACTATGAAACAATGCCATTATATGAGGTTTGGTTTGAAGTAAAAGATTCTGATAATCCACCATTAAAATCTTTTATTGAAATTGAAATTAAAGTTACGGATGCTAATGATAATGCTCCTATTCTTGAAAATTTGTTATATAACGCATCCATTCCTGAAGAAGAATCCCCACCACAAACGGTGATAAAGATTGAAGCTCATGATGATGATTCAAATGAAAATGGAAGAATTTCTTATAGACTTGTGAATGATTACGAAGAAACTTTTGCTATTGATTCTGATAGTGGTGAAATCTTTACCAATATTGCTTTAGACAGAGAATCAATACCATTCTATGAAATTTTAGTTGAAGCTGTTGATCATGGAATACCGCAATTAGTTGGCACATCTACTGTTCTGGTGTCTGTTTTAGATAAAAATGATAATCCACCAAGATTTACTCGACTTTTTAGCGTTAATGTAACTGAAAATGCTGAAATCGGTTCTTTCGTTATACGAGTAACAAGTTCTGATTTGGATACAGGTCCCAATGCTAATGCTACATACAGTTTTGTGGAGAATCCTGGAGAAAAATTTGTGATAGATCCAATCAGTGGAAATGTTACTGTCGCTAAGCCATTAGATAGAGAGCTACAAGATGAATATATTCTTAAAGTTGCAGCCATAGATGGAGCTTGGCGCTCTGAAACACCTTTGACTATAACGATTCAAGATCAAAATGATAACGCTCCTGAGTTTGAATATTCTTATTATAGTTTCAACTTTCCTGAACTTCAAGAGAAAAACAGTTTTGTCGGTCAAGTAATAGCTACTGACAAAGATAAACAAGGTTCGAATTCTATTATATCTTACTCCTTACAACAAAGCTCGGACCTATTTTCAATTGACCCTGCCACTGGAGAGATAGTTACTAAATTTATGATGAATTACAAAAGAACGTCTGTTAATACATCCCCAGAAAATACATATTCTGTTATAGTCGTCGCTACTGATAATGGAAAGCCACCCATGTCATCTGAGTGTTTAGTCACTATAAATGTTGTAGATGCAAATAATAATAAACCTAAATTTAAAGAGCATGAGGATTTAGTACCGGTTCCTCAAGATGCTACGGTCGGAGAAAAAATAATACAACTTCAAGCCGAAGATAATTTAGATTTCGGTATAAATGCTGAAATTGAATATAATATATTTGGTGGTAATGGCACGACTTATTTTTCTATTGATAAACTTAATGGGTGGATTATTATCGGAAAACAATTTTATTATACTGGGCAGTATTACCACATCAAAGTTAAAGCAATAGATCGTGGTGTACCACCACAATGGGATGAAACAACAGTAACTTTTGTCGTTACTGGAGAAAACATTTATAGCCCACGATTTACAGCTTTGAGTTATCAAGTGATAGTTCCAGAAAATGAACCAATAGGTTCACCGATATTGTCATTGGATGCTAAAGATGAAGATGAGGGACCCAATGGTATAGTAAGATATACAATTACATCTGGCAATGAAGAGAAAGAATTTAAAGTAGATCCAGTTACTGGTACTATAAGTATTCTAAGATCACTTGATTATGATGAAATCCAAGAATATCGCCTTAATATTACTGCAAAAGACTTAGGTTTCAAACCGAAAGAAACGACAGCTACGGTAACAATTATTTTAACAGATATAAATGATAATGCTCCCCAATTTAATCAGTCTCAATACGTTGCTTATTTAACTGAAAATTCACCGGCCAAGAGTTTTATTTTTAAAGTGAAAGCAACAGACATTGATTCACCCAAAAATGCTATTATAAAATATTACATTAAAAATGAAATGTCAGCCTTGTTTTCCATAGATGAAAATTCAGGTGACATTTTTTCTAATGAGGTTTTTGATTTCGAAGAAAAGACCGTTTATAACTTACAAATACTGGCTGAAAATCCTGATTCGGTTATGCAAAGTACAGCAGAAGTTATTGTTTACATCACAGGCATAAATGAATATTACCCGAAATTCATTCAACCGGTGTTTCATTTTGATGTTTCTGAATCAGCTGAAGTTGGCACAAATGTTGGTGTTATTCAGGCTACTGATCAAGACAGTGGAGATGATGGAATAATATATTATTTACTAGTCGGTTCAAGTAATGATAAAGGATTTAGTATCAATTCCCAAACTGGGGTTATAAGAGTTGCAAGATATTTAGATAGAGAAACACAAAATAGAGTTGTACTGACAGTGCTTGCAAAAAATTCAGGTGGAATACATGGAAATGATACTGATGAAGCTCAAGTAATAATTTCAATTCAGGATGGAAACGATCCTCCTGAATTCCTAAGAAATTATTATGAAGCAACTATATCTGAGGGCGCTCAAGTTGGTGAAGAAGTTATCCAAGTTAAAGCTGTAGATAAAGATGTTCGATCACAAAATAACCAATTTAGTTTTTCTATCATAGACGGAAACTTAAACCAAGATTTTAAAATAGATCCTCAGGGTGGAAGTATTGAAGTTGCTCGAAA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Protein sequence:

>DPOGS208460-PA
MQFTDVTIVVQVTDTNDNPPMFKESAYSFDIPENAARGSVVGTVAAIDLDSGPNAQLTYNVISDWANDVFSLNPQTGIFTLTARLDYEETQHYIIVAQAQDNGHPSLSGTVTVYINVIDLNDNAPVFDPMSFSNEILEDVPVGSSVVTVSATDIDSGFNGKLTYSIFSGDDNQDFKISSNGTIFTSSLLDRETIPIYNLVITAKDLAKPPEPRLSATVQVTILLKDVNDMAPEFISPKTTAISENIPLNTVIMTVKAVDKDEGRNGYVEYFMAPDPEVDGYFTLGNVDGILRATGKLDRELKSNFTILLTAKDRGDPPNVTKGKIFIKILDENDNSPVFDPKQYSASVPENASIGASVLQVSATDVDEGINGRVRYSIASGDENRDFSISEDTGIVRVAKNLNFERKSRYILSIKAEDCGKDDIRFDTAELSISIQDINDNPPTFLDTPYLAYVMENVIPPYGGYILTVQAYDADSPPFNNQVRYFIKEGDSDLFKINASSGQISLLRTLDREAQDEYTLSLVAMDTGSPPLTGSGTVKIIVQDVNDNSPDFQRQSYKTSVKENLPPETEILHPKAIDKDIGNNAKIRYSLLGDKSERFRIDPVTGVVYTNATLDREEWEVYYLIIMAQDSSTTDPRTATANLTIIVEDENDNTPTFPQSLYEVYISERTVQGDFVFGVKAKDNDIGDNKKIVYDIKGEHHSLFTINKDTGVIKAKENLMKYKDKMRSTFNLIILATDSGTFPRESSAELILIPKSGKNFPKFTVNNKLTFSFSEDTPEGVLVTRLSATSPKIGPTGLLQYSVAGGNVGDALRVEPMSGEIFITGRGFDYETMPLYEVWFEVKDSDNPPLKSFIEIEIKVTDANDNAPILENLLYNASIPEEESPPQTVIKIEAHDDDSNENGRISYRLVNDYEETFAIDSDSGEIFTNIALDRESIPFYEILVEAVDHGIPQLVGTSTVLVSVLDKNDNPPRFTRLFSVNVTENAEIGSFVIRVTSSDLDTGPNANATYSFVENPGEKFVIDPISGNVTVAKPLDRELQDEYILKVAAIDGAWRSETPLTITIQDQNDNAPEFEYSYYSFNFPELQEKNSFVGQVIATDKDKQGSNSIISYSLQQSSDLFSIDPATGEIVTKFMMNYKRTSVNTSPENTYSVIVVATDNGKPPMSSECLVTINVVDANNNKPKFKEHEDLVPVPQDATVGEKIIQLQAEDNLDFGINAEIEYNIFGGNGTTYFSIDKLNGWIIIGKQFYYTGQYYHIKVKAIDRGVPPQWDETTVTFVVTGENIYSPRFTALSYQVIVPENEPIGSPILSLDAKDEDEGPNGIVRYTITSGNEEKEFKVDPVTGTISILRSLDYDEIQEYRLNITAKDLGFKPKETTATVTIILTDINDNAPQFNQSQYVAYLTENSPAKSFIFKVKATDIDSPKNAIIKYYIKNEMSALFSIDENSGDIFSNEVFDFEEKTVYNLQILAENPDSVMQSTAEVIVYITGINEYYPKFIQPVFHFDVSESAEVGTNVGVIQATDQDSGDDGIIYYLLVGSSNDKGFSINSQTGVIRVARYLDRETQNRVVLTVLAKNSGGIHGNDTDEAQVIISIQDGNDPPEFLRNYYEATISEGAQVGEEVIQVKAVDKDVRSQNNQFSFSIIDGNLNQDFKIDPQGGSIEVARNLDREKVSTYSLIIGAIDTGVPPETGTATVKITLTDINDNGPVIDTASFNGAVYENEPPNTSITTLSANDPDLPPNGAPFTYAIIGGRHENYVKVQKHTGVLLTNKRIDRELTPYLDIVIQVEDSGTPVMYSNFSLQIKILDKNDNPPSPRSAHVLVYTFNNKIPSGPIADVKPNDSDIVGDYECKLIKYSTSDTTLSLFNIRKGCDLYTNTVKPGQGYSFSVSGNDGIHKDVVSSISVEFFSFTNSTVEQSITARIINMTATDFLTYYYRTVLEIFRDGLKNKEIVYLYSINEKMEDIDLLIAIKDNNSVWSKENTEKHLKSKELEIQKVLKRQVIIPFYPCSAHRCQNEGTCTDAIDVLDGTKIVESSSLILSSPLVRHDYVCHCIDRFTGSNCEKRQDPCSPNPCQFGGVCRKLGHDFVCSCSSRRHGKTCELERNDVCSSNPCKNGGSCKESADRNSFFCLCRPGYRGSQCEALVDSCRPNPCLHGGICIGLKPGYKCSCINGRYGTHCESSTFGFDELSYMQYPALDASTNDITIIFATTKSDALLLYNYGAQTGGRSDFIAIEILGGKPLFSFGGSRTSITSVALMDTDKNLGDGKWYKLTATRNGRVISLSIGSCTDHGDVCTECEPGDDSCYNDDTGQAGTLNFNNEPLLIGGLRKADPVLERPGQIHSDDFVGCLHSITINGRILNLTNPLDSRGVHPNCARREKGACFKQEICGSGQCIDRWKTHYCKCDNNIISTDCSMSLQSISVGETGFISYVITEKHRRMQLLDSFYGGSTMWERKLSKGKTIPKLNPAKYLSFLFRTYRKEGVLFYSATDKYYTLIELLGGKVTYTSKQNTIVNMSQTETFDVSDGNWHNITLLAHGRSIRLIIDNKNIGEELDAAGVHDFLDPYLTTISLGGIKAEWITNYNKFEGCFANFTVNNEIQPFAGNGSIFKEVTKTGKILPGCHSAFGAGLVQNPDPLNIGLILVISFFIILLVAIAVSFLVFRLRKQKKEIGNTPTSKGNMSHTKQNGGPAMLNTPNLIAGTNDSLINRNIHNNDTSLNSYISENADIMRNVGHIVGPELLSKKYKDRDIMNLDHPRSQRPDIIEREVVGKSPALREDHHSPPPLSTNTSHHTHDHPSGMDMNSEVPEHYDLENASSIAPSDIDIPYHYKAFREAAGVRKYKATPPPIASYHHKHQTPQHRHSPHHPSGYPPRVLSQNSQPPPQTRQHQTTPLARLSPSSELSQQPRILTLHDISGKPLQSALLATTSSSGGVGKDPLHSNSERSLNSPVMSQLSGQSSSAGRKTPSATPQVPQVVSVGTGAVGLTAEEIERMNARQRTSSLVSTLDAVSSSSEAPRGGGVSHHMSHRQHSPPVDNRSSTGSDDESGNDSFTCSEIEYDNNSISAEKPEDIRRSNVNSGNNNKKPILPPPYESFDSSFRGSLSTLVASDDDLVPHVGSALYRQANGSPAAATLSWDYLLNFESMIGVFKDIAELPDSVNGRMSSSLRLPNGTPKPSEEYV-