Monarch geneset OGS2.0

DPOGS215748
TranscriptDPOGS215748-TA8856 bp
ProteinDPOGS215748-PA2951 aa
Genomic positionDPSCF300041 + 846119-860933
RNAseq coverage1x (Rank: top 95%)
Annotation
HeliconiusHMEL0040820.096.66% 
BombyxBGIBMGA003622-TA0.088.17% 
DrosophilaDhc93AB-PB0.081.38% 
EBI UniRef50UniRef50_P230980.072.65%Dynein beta chain, ciliary n=48 Tax=Opisthokonta RepID=DYHC_TRIGR
NCBI RefSeqXP_971055.20.084.43%PREDICTED: similar to dynein heavy chain [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastpgi|1892338860.084.43%PREDICTED: similar to dynein heavy chain [Tribolium castaneum]
NCBI nr blastxgi|1892338860.084.43%PREDICTED: similar to dynein heavy chain [Tribolium castaneum]
Group
Gene OntologyGO:00070180microtubule-based movement
GO:00302860dynein complex
GO:00037770microtubule motor activity
GO:00055241.1e-12ATP binding
GO:00168871.1e-12ATPase activity
KEGG pathway 
InterPro domain[2244-2950] IPR0042730Dynein heavy chain
[2-346] IPR0136022.3e-108Dynein heavy chain, N-terminal domain-2
[791-925] IPR0117041.1e-12ATPase, AAA-5
Orthology groupMCL10001 Multiple-copy universal gene
Genotypes for resequenced monarchs and outgroup Danaus species

Nucleotide sequence:

>DPOGS215748-TA
ATGCTCACATCTTTAAGGGCTGTAGCAGAATTGCAAAATCCTGCGATAAGAGAAAGACACTGGGATCAACTAATGAGAACAACTAAGAGCTTAGCTGCCTTGCCACCCGAACTCACAGTAAGAATTGTAATGGATGCTAACACAACTTTAGCTGATTTGCTAGCATTAAACTTACACGAGTTCGAAGAAGAAGTGAAAAACATTGTCGATAAAGCGGTCAAAGAAATGTCTATGGAAAAAATTCTTAAAGATCTCAACGTAACATGGAGCGGAATGGAATTTGAACAAGAAGTGCACACAAGAACTGGCTGCGTTTTGTTAAGAGCCAGTGAAGAGCTCATAGAAACGCTTGAAGAGAATCAGGTACAATTACAAAATCTGATAACATCTAAGTTTATTGCACATTTCTTAGAAGAGGTCTCGGGCTGGCAGCAAAAGTTGTCTATAGCAGATCAAGTCATTACAGTTTGGTTCGAAGTTCAAAGGACTTGGACTCACTTAGAAAGTATCTTTATGAGTTCGGAGGACATAAGGAAACAATTGCCAGATGATTCTGCTAGATTTGACAGAATAGATGCTGAATTCAAGATTTTATCAAGAGACATGGCAAAAACCCCGAACGTTGTTAAGGGGACAAATAAAGAGGGACTTGTAGGCATTCTAGACAGTTTACAAAAAGATTTAGTGATATGCGAAAAGGCTCTCGCCGAATATTTGGAAACGAAAAGACTGGCGTTTCCAAGATTCTATTTTGTATCATCAGCAGATCTTTTGGATATTTTATCGAACGGTAATCAGGCAGAATTAGTCATCAGACATTTAACAAAATTATTTGATTCCATTGCTAAACTTCAATTTATTGAGAGTGAGAAACCTGGAGAAAAGACCGCTTCAGGAATGATAGCAAAAGATGGGGAACTTGTTTCTTTTCAAGGTCTTTGTGACTGCACTGGACCAGTCGAAATTTGGCTGAATCGTTTACAAGACATAATGAGATCGTCAATTCGTCAATATTTTGGAGAAGCGATTGTATCTTATGAAGAAAAGTCACGTGAACAATGGCTTTTCGACTTTATGGCTCAGGTGTCTCTATGTTGTACACAAATTTGGTGGACATCTGAAGTTAATATTGCATTTGGTAGATTAGAAGAAGGTTATGATAATGCACTTAAAGATTACTACAAAAAGCAACTGTCTCAACTTAGTACGTTAATAACGCTATTAATTGGAGAACTCAGCAAGCAGGATCGACAAAAGATAATGACAATTTGTACCATAGATGTCCATTCAAGAGATGTTGTCAGCAAGTTGATCCAGGGGAAAGTTGAATCAGGATCTGCGTTTCAATGGCAATCTCAATTAAGACACAGGTGGGGCGAAAAAGAACTTCATTGTTTTGCAAACATTTGCGATGCTCAGTTTACGTACAGTTATGAATATTTAGGAAATACACCAAGATTAGTAATAACCCCTCTTACTGATCGTTGTTATATAACATTAACTCAGTCTCTGCATTTGATAATGGGTGGAGGACCTGCTGGCCCAGCTGGAACTGGGAAAACTGAAACCACAAAAGACTTAGGCAGAGCTTTGGGCATAATGGTTTATGTATTTAATTGTTCGGAACAGATGGATTACCAGTCTTGTGGAAATATTTATAAGGGCTTAGCTCAAACTGGTGCCTGGGGATGTTTCGATGAATTTAACCGAATTTCGGTTGAAGTACTTTCAGTAGTAGCAGTGCAAGTTAAATCTGTTCAAGATGCTATAAGGGATAAAAAAGATAAGTTTAATTTTATGGGAGAGATCATAGTTTTGGTTCCAACTGTGGGCATTTTCATTACAATGAATCCTGGTTACGCAGGTAGAACTGAATTGCCAGAAAACTTAAAGGCTCTGTTTCGGCCATGTGCTATGGTGGTGCCCGATTTTGAGTTAATTTGTGAAATAATGTTAGTAGCAGAAGGTTTTCAGGATGCTAAAATATTAGCAAGAAAGTTTATCACTTTATATACCTTATGTAAGGAGTTATTATCAAAGCAAGATCATTATGATTGGGGTTTAAGAGCTATCAAATCGGTTTTGGTTGTTGCCGGTTCTTTAAAGAGAGGCGATCCTGGGAGACCAGAAGAAGAAGTGCTCATGAGAACTTTGCGTGATTTCAATATACCGAAGGTAGTTACTGATGACATGCCAGTATTCATGGGTTTGATTGGGGATTTATTCCCTGCTTTAGAAGTACCTAGAAAAAGAGATTTAGAATTTGAGAGAACAGTTAAACAAGCAGCTATGGATTTGCTTCTTCAACCAGAAGATAATTTTATACTGAAAGTAGTGCAATTAGAAGAACTGCTAGAAGTTAGACATTCCGTCTTTATTGTTGGCAATGCAGGTACTGGTAAAACTCAGGTTTGGAAAACTTTGTTTAAAACCTATCAAAATCTCAAGAAAAAACCACTGTTTAATGATTTAAATCCAAAAGCGGTTACAAACGACGAATTGTTTGGAATTATCAACCCCGCAACTAGAGAATGGAAAGATGGTTTATTTTCTGTAATCATGAGAGATCAAGCAAATATTGTTGGCGAGAATCCGAAATGGATAGTGTTAGATGGCGATATAGATCCGATGTGGATCGAGTCATTAAATACAGTAATGGATGACAATAAAATTTTAACTCTGGCAAGTAATGAGCGAATTGCACTTACACCAAGCATGAGACTGATGTTCGAAATATCAAATTTACGCACTGCCACACCCGCTACTGTTTCTCGAGCTGGTATTTTATATATCAATCCGCAAGATTTGGGATGGAACCCATACGTAACCAGTTGGGTGGAAACTAGAAAGATTCCCGCTGAAAAATCGAACTTGGTTATTTTATTCGATAAATACATTCCTCCTTGTTTAGAAAATATTCGAAATAGATTTAAAAAAATAACCCCTATAGCAGATATGGCTCACATACAGATGCTTTGTCATCTATTGAGTTGTTTATTAGTTCCTGAAAACACTCCTCCAGATTGTCCAAAGGAATGGCATGACATATTTTTTGTATTTGCTTGCGTTTGGGCATTTGGGTCTGCTATGTTTCAAGATACAAATGTGGATTATAGGATTGAATTTTCAAAATGGTGGGTTAATGAATTTAAAACTGTTAAGTTTCCTGCTGGTGGTACCGTTTTTGACTATTATATTGACCTTGAAACGAAACAGTTTACACCTTGGACTGAAAAAATTACAAAATTTGAATTGGATAGCGATATACCTCTACAGGCAAAGATGCTGCAAAAGATTCTTGAGAAACCACTTGAAAAGAAGGCAGGAAGAAATTATGGTCCGCCCGGAAATAAGACTCTAATTTACTTTATTGACGATATGAACATGCCTGAAGTCGATCCTTACGGCACTGTACAACCACACACAATAATACGACAGCATTTAGATTATAACCATTGTACAAATGAATGCTTAGTAAATCCGTCGGATTTAATACGTCTTTGGTTACACGAAACTCACAGAGTCTATGGGGATAAACTAACAGAGGACAAAGATATTGATGCATTCCTGAAAATGCAAGTGGATCTTTGTAAGAAAAATTTTGAGGATATTGATGAAGGAGCAGTGTTTGAACGTCCAAATATTTATTGTCATTTTGCGGGAGGAATTGGAGAGCCAAAATATATGCCTGTAGCGTCATGGGTACAACTTAATAGACTGCTTACTGAGGCGCTTTCTAGTTACAATGACCTTATTGCAGCTATGAATCTTGTTTTGTTTGAAGATGCTATGATGCACATATGCAGAATAAGTCGAATACTTGAAAGTCCTCGGGGGAGTGCGCTTCTAGTTGGCGTTGGTGGCTCTGGAAAACAGTCGTTATCTCGTTTAGCAGCTTTTATCTCCAGCTTGGAGGTATCTCAAATTCAACTTAAGAAGGGATATGGTGTATCCGATCTGAAGAATGAACTTTCCAGTTTGTATATAAAAACCGGTCTTAAAAATGTTGGTATTATGTTCCTGATGACTGATGCTCAAGTAGCCAATGAACAATTTTTGGTTTTAATAAACGATTTGTTAGCCTCCGGTGAAGTAGGTGATTTGTTCCCCGATGACGACATGGAGAATATTATTGCTGGTGTTAGAAATGAGGTTAAAGGTGCTGGTCTTCCGGATACTCGAGAAATTTGTTGGAAATTCTTTATAGATCGTGTTCGTAAGCAACTCAAGGTTGTATTGTGCTTTTCGCCGGTGGGATCTACATTAAGAGTAAGATCTAGGAAGTTCCCGGCGTTGATAAATTGTACATCAATAAATTGGTTCCACGAATGGCCTCAAGAAGCTTTGGTCTCTGTATCCATGAGATTTTTAGAAGAATTATTGGTTTTACCGATAACTTTAAGAGATTCTGTATCAAGGTTTATGGCGTATGTACATACTTCCGTAAATACTATATCTAAAGCTTATCTTTCAAACGAGAGGAGATACAATTATACAACACCGAAGAGTTATCTAGAACAGATAAGTTTGTATGCAAAATTAGTCAGCCAAAAAACGGATGAACTTAGAGCAAAAATAACCAGATTAGAAAATGGTTTGGAAAAACTTCGTAGCACAGCTTCTCAGGTAGATCAGCTTAAAGCTAAACTGGCCATACAAGAAATAGAATTACAACAAAAAAATGAAGCTGCAGATAAACTTATAGAAATGGTGGGTATAGAGACTGCAAAAGTACAAAGTGAAAAAGCATTAGCTGACGAGGAGGAAGAAAGGGTTGCGGTAATTGCCGAGGAAGTGTCTAAAAAGCAAAAAGATTGTGAGGAAGACCTTATAAAGGCTGAACCAGCATTGGTGGCTGCTCAAGAGGCGTTGAATACTTTGAATAAAGCAAATCTGACCGAATTAAAGTCGTTTGGTTCTCCCCCTGGAGTAGTAACGAATGTAACAGCTGCTGTAATGGTTCTATTAGCTCCTGGTGGAAAAATTCCAAAGGATAGAAG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Protein sequence:

>DPOGS215748-PA
MLTSLRAVAELQNPAIRERHWDQLMRTTKSLAALPPELTVRIVMDANTTLADLLALNLHEFEEEVKNIVDKAVKEMSMEKILKDLNVTWSGMEFEQEVHTRTGCVLLRASEELIETLEENQVQLQNLITSKFIAHFLEEVSGWQQKLSIADQVITVWFEVQRTWTHLESIFMSSEDIRKQLPDDSARFDRIDAEFKILSRDMAKTPNVVKGTNKEGLVGILDSLQKDLVICEKALAEYLETKRLAFPRFYFVSSADLLDILSNGNQAELVIRHLTKLFDSIAKLQFIESEKPGEKTASGMIAKDGELVSFQGLCDCTGPVEIWLNRLQDIMRSSIRQYFGEAIVSYEEKSREQWLFDFMAQVSLCCTQIWWTSEVNIAFGRLEEGYDNALKDYYKKQLSQLSTLITLLIGELSKQDRQKIMTICTIDVHSRDVVSKLIQGKVESGSAFQWQSQLRHRWGEKELHCFANICDAQFTYSYEYLGNTPRLVITPLTDRCYITLTQSLHLIMGGGPAGPAGTGKTETTKDLGRALGIMVYVFNCSEQMDYQSCGNIYKGLAQTGAWGCFDEFNRISVEVLSVVAVQVKSVQDAIRDKKDKFNFMGEIIVLVPTVGIFITMNPGYAGRTELPENLKALFRPCAMVVPDFELICEIMLVAEGFQDAKILARKFITLYTLCKELLSKQDHYDWGLRAIKSVLVVAGSLKRGDPGRPEEEVLMRTLRDFNIPKVVTDDMPVFMGLIGDLFPALEVPRKRDLEFERTVKQAAMDLLLQPEDNFILKVVQLEELLEVRHSVFIVGNAGTGKTQVWKTLFKTYQNLKKKPLFNDLNPKAVTNDELFGIINPATREWKDGLFSVIMRDQANIVGENPKWIVLDGDIDPMWIESLNTVMDDNKILTLASNERIALTPSMRLMFEISNLRTATPATVSRAGILYINPQDLGWNPYVTSWVETRKIPAEKSNLVILFDKYIPPCLENIRNRFKKITPIADMAHIQMLCHLLSCLLVPENTPPDCPKEWHDIFFVFACVWAFGSAMFQDTNVDYRIEFSKWWVNEFKTVKFPAGGTVFDYYIDLETKQFTPWTEKITKFELDSDIPLQAKMLQKILEKPLEKKAGRNYGPPGNKTLIYFIDDMNMPEVDPYGTVQPHTIIRQHLDYNHCTNECLVNPSDLIRLWLHETHRVYGDKLTEDKDIDAFLKMQVDLCKKNFEDIDEGAVFERPNIYCHFAGGIGEPKYMPVASWVQLNRLLTEALSSYNDLIAAMNLVLFEDAMMHICRISRILESPRGSALLVGVGGSGKQSLSRLAAFISSLEVSQIQLKKGYGVSDLKNELSSLYIKTGLKNVGIMFLMTDAQVANEQFLVLINDLLASGEVGDLFPDDDMENIIAGVRNEVKGAGLPDTREICWKFFIDRVRKQLKVVLCFSPVGSTLRVRSRKFPALINCTSINWFHEWPQEALVSVSMRFLEELLVLPITLRDSVSRFMAYVHTSVNTISKAYLSNERRYNYTTPKSYLEQISLYAKLVSQKTDELRAKITRLENGLEKLRSTASQVDQLKAKLAIQEIELQQKNEAADKLIEMVGIETAKVQSEKALADEEEERVAVIAEEVSKKQKDCEEDLIKAEPALVAAQEALNTLNKANLTELKSFGSPPGVVTNVTAAVMVLLAPGGKIPKDRSWKAAKIMMAKVDVFLEQLINYDKENIHPDVIKAIQPYLKDSEFEPEFVKSKSAAAAGLCAWVINIIKFFEVFCDVEPKRKALAAANAELAAATEKLKAIKSKVASLEEQLAALTADFEKAIAEKLKCQQEADATNRTIQLANRLVNGLASENVRWADSVSIFMQQSTTLPGDVLLVCAFISYVGCFTKLYRLDLLHKNWLTFLKTLEPPIPITEGIDPLTMLTDDTTIAMWHNEGLPSDRMSTENATILSNSDRWPLMIDPQLQGVKWIKQKYGDTLRVIRLGQKGYLDTIEKAIIKGETVLLENIGETVDPVLDPLLGRNLIKKGRAIKIGDKEIEYSPNFRLILHTKLANPHYKPEMQAQTTLVNFTVTRDGLEDQLLAEVVKAERPDLEELKAELTKQQNEFKIQLKKLEDDLLSRLSSAGENILGDTALIENLEITKKTAADIEKKVTEAKVTSHQIDQAREFYRPAAARASLLYFILNDLNSINPIYQFSLKAFSVVFQKAISRAEPAEEVSQRIKNLIDCITYSVFQYTSRGLFECDKLIFASQMTFQVLLMSEEVSPAELDFFLRFPIKPHVTSPVDFLSNHSWGGICSLASKDEFRNLDRDIETSPKRWKKIVEMECPEREKFPQEWKNKTALQRLCMLRALRPDRMTYAVATYIEEKMGSKYVENRTLEFSKSFEETSPTTPIFFILSPGVNPLKDVEALGKAMGFTTDCGNFHNVSLGQGQEIVAEQAMDESLQKGHWVVLQNIHLVKKWLPSLEKKMESFAGGCHPDFRLFMSAEPAATPSAHIIPQGILESSIKITNEPPTGMQANLHKALDNFNQETLEMCGKEAEFKAILFALCYFHAVVAERRKFGPQGWNKIYPFNVGDLTISVFVLYNYLEANSKVPWEDLRYLFGEIMYGGHITDDWDRRLCNAYLEELMQPDLVDGELQLAPGFPAPPNTDYLGYHQYIEDAMPQESPYLYGLHPNAEIGFLTTTSENLFRTIFEMQPRDAQASGASTVTREDKVKQMLDEVMEKLPEEFNMVEIMGKVEERTPYVIVAFQECERMNHLTGEMKRSLRELDLGLKGELTITSDMEELENALFLDQVPAIWANRAYPSLLGLSAWFVDLLLRLRELETWATDFVLPMSVWLGGFFNPQSLLTAIMQSTARRYELPLDKMCLQCDVTKKMKEDFTIADTRCAPRDGAYVHGLLMEGARWDVHAGIIMDSRLKDLFPPMPVINVRAITQDKQDMRNMYECPVYKTRTRGPTYVWTFNLKTKDKPSKWTLAGVALLLQT-