New model in OGS2.0 | DPOGS205295  |
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Genomic Position | scaffold310:+ 47586-51473 |
See gene structure | |
CDS Length | 3888 |
Paired RNAseq reads   | 392 |
Single RNAseq reads   | 1082 |
Migratory profiles | Query via corresponding ESTs |
Best Bmobyx hit | BGIBMGA011037 (0.0) |
Best Drosophila hit   | Toll-7 (0.0) |
Best Human hit | slit homolog 1 protein precursor (2e-36) |
Best NR hit (blastp)   | 18 wheeler [Bombyx mori] (0.0) |
Best NR hit (blastx)   | 18 wheeler [Bombyx mori] (0.0) |
GeneOntology terms    | GO:0005886 plasma membrane GO:0004888 transmembrane receptor activity GO:0006952 defense response GO:0016021 integral to membrane GO:0007165 signal transduction GO:0005515 protein binding GO:0031224 intrinsic to membrane GO:0045087 innate immune response |
InterPro families    | IPR000157 Toll-Interleukin receptor IPR003591 Leucine-rich repeat, typical subtype IPR000372 Leucine-rich repeat-containing N-terminal IPR001611 Leucine-rich repeat |
Orthology group | MCL10076 |
Nucleotide sequence:
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CCCATTGTAGATACAGGTAGCGGTGGCGTACAAGCTTACCTAGTCTAG
Protein sequence:
MYAVTTVFCVLLHFVWSVPSYGLDKCVRQDSGNSIICRIRTLDSDGSSISTVNSETYALN
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