Genomic Position | scaffold1714:+ 7777-22021 |
---|---|
See gene structure | |
CDS Length | 633 |
Paired RNAseq reads   | 1220 |
Single RNAseq reads   | 5833 |
Migratory profiles | Query via corresponding ESTs |
Best Bmobyx hit | ND |
Best Drosophila hit   | NADH dehydrogenase subunit 5 (7e-34) |
Best Human hit | NADH dehydrogenase subunit 5 (1e-20) |
Best NR hit (blastp)   | NADH dehydrogenase subunit 5 [Danaus genutia] (6e-52) |
Best NR hit (blastx)   | NADH dehydrogenase subunit 5 [Danaus genutia] (4e-38) |
GeneOntology terms    | GO:0005739 mitochondrion GO:0016491 oxidoreductase activity |
InterPro families   | IPR001750 NADH:ubiquinone/plastoquinone oxidoreductase |
Orthology group | MCL10998 |
Nucleotide sequence:
ATGTTGAGGAAAAAAGCTGGTATTAGAGCAAATTATGAATATGATTTAAAAAAAATTATT
GCTTTGTCTACTTTAAGACAATTAGGTTTAATAATAAGAATTTTAAGAATAGGTTATAGA
GATTTAGCTTTTTTTCATCTTCTTACTCATGCAATATTTAAAGCTTTATTATTTATATGT
GCAGGTGTAGTAATTCATAGAATAAATGATAATCAAGATATTCGAATAATAGGGGGGGTA
AGAATTTTCATTCCTGTTACTTCTTTATGTTTTAATATTTCAAATATAGCATTATGTGGT
ATTCCTTTTTTAGCTGGATTTTATTCAAAGGATTTAATTTTAGAAATATTAATTAAATTA
ACAATTTTAAATGTTATAATTAGTGGGAAAATTAAAGCAATTTCTACATCAAAAATAAGG
AAAATTATTGTAATTAAAAAGAAATGTAGAGAAAAGGGAATACGTGGTAATGATTTAGGA
TCAAATCCACATTCAAAAGGAGAACATTTTTCTCGATCTAAAATTGATTTTTTTGAAATA
ATAAAAGAAATAATTATTAAAATTATTGAAATAAAAAATGTAATAATTGATATAATTAAT
AATAAAATAATTATTTATATTAATAACAATTAA
Protein sequence:
MLRKKAGIRANYEYDLKKIIALSTLRQLGLIIRILRIGYRDLAFFHLLTHAIFKALLFIC
AGVVIHRINDNQDIRIIGGVRIFIPVTSLCFNISNIALCGIPFLAGFYSKDLILEILIKL
TILNVIISGKIKAISTSKIRKIIVIKKKCREKGIRGNDLGSNPHSKGEHFSRSKIDFFEI
IKEIIIKIIEIKNVIIDIINNKIIIYINNN