New model in OGS2.0 | DPOGS213860  |
---|---|
Genomic Position | scaffold3220:+ 8143-13986 |
See gene structure | |
CDS Length | 5199 |
Paired RNAseq reads   | 1196 |
Single RNAseq reads   | 2673 |
Migratory profiles | Query via corresponding ESTs |
Best Bmobyx hit | BGIBMGA009774 (0.0) |
Best Drosophila hit   | CG31755 (3e-28) |
Best Human hit | tudor and KH domain-containing protein isoform b (7e-11) |
Best NR hit (blastp)   | RNA helicase-like protein [Bombyx mori] (1e-145) |
Best NR hit (blastx)   | RNA helicase-like protein [Bombyx mori] (4e-141) |
GeneOntology terms    | GO:0004004 ATP-dependent RNA helicase activity GO:0003676 nucleic acid binding GO:0005524 ATP binding |
InterPro families    | IPR014001 DEAD-like helicase IPR002999 Tudor domain IPR008978 HSP20-like chaperone IPR008191 Maternal tudor protein IPR011545 DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal IPR018351 Tudor subgroup IPR007052 CS-like domain |
Orthology group | MCL10801 |
Nucleotide sequence:
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GTGAGTAACTCTAGCATTCCACAGCCTATACGTTCAGTACCTTTAATAAATTCGGATGAA
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TTTGGGACGGTGGCAAATAAATGTGCGATCACTAATTCCGATAGTGCAAAAACACCACAA
ACATCTTACGAAATGATTTCTCCGTGTGAAAGAAGCAAAGCTATTACACAGGAATTAGAC
TCGGATGACTTAACGTCGCCGGAGCTATCTGAAATATCGAAGACGCCAGTCAAACGGAAC
GTTGTTAAGGAATTAGATCAAAAACGACATCCAAAGATAATGTGGCATCAAAATAAAAGC
ACAATATACGTTAAAATACATTTAGTTGTCGACAATTACGATTTACTCATCGACGACAGA
AAATTAGAATTCCTCGCTTTAACAAACGACATAAAATACGGATTCGACTTAGAACTGTTT
GGTGTTGTTAAAACTGAGAATTCTACGCACGTCAACAAAGGACAGTATGTGTTAGTTAAA
CTAGCGAAAGTTCTGAACAAGAGCTGGCTAACGCTCACTCGGAACGGCGACACGAAGTGG
GTAGTTTACGACGTGGACTTCATTGACACGTCGTCAGACGAAGAAGTTGTTGACAGAAGC
TCGGTTATGAATATTGTTATAAGTTTAAACGACAACGCGGACACGGATACTGACGACGAG
CAATTCTGTGATGATGCGAATTTTACATACAAAAAATAG
Protein sequence:
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