Monarch geneset OGS2.0

DPOGS202901
TranscriptDPOGS202901-TA5166 bp
ProteinDPOGS202901-PA1721 aa
Genomic positionDPSCF300126 + 104368-120226
RNAseq coverage33x (Rank: top 75%)
Annotation
HeliconiusHMEL0162930.052.78% 
BombyxBGIBMGA004172-TA1e-17850.00% 
DrosophilaCG5195-PA9e-4425.95% 
EBI UniRef50UniRef50_E9CJE91e-5428.10%Tyrosine-protein kinase Src42A n=23 Tax=Opisthokonta RepID=E9CJE9_CAPO3
NCBI RefSeqXP_001656813.13e-4523.89%leucine-rich transmembrane protein [Aedes aegypti]
NCBI nr blastpgi|3201662085e-5428.10%tyrosine-protein kinase Src42A [Capsaspora owczarzaki ATCC 30864]
NCBI nr blastxgi|3201662088e-7325.31%tyrosine-protein kinase Src42A [Capsaspora owczarzaki ATCC 30864]
Group
KEGG pathwaydme:Dmel_CG51958e-42 
 K05401 (TLR3)maps-> Toll-like receptor signaling pathway
Orthology groupMCL21017 Lepidoptera specific
Genotypes for resequenced monarchs and outgroup Danaus species

Nucleotide sequence:

>DPOGS202901-TA
ATGATGTTTCTGCACTTTATGATAATACTGCTTGCTGCTTTGCCATGTATTTGTGGAGAATGCCATTTCATACCTTTGCCTAAATTAGAAAAGTGCCGTGCTGCACTGAACTGTTCCATTACTTTGACTAACCCCTCAAGTAATCTAGATTCATGGACGTGCATACGAAAGCAAAAGGTCAACTACGATTATTACTACCGAAATAACTATGACAACAGTTATACTCTTGATACTAATTACGAGTTATACATTACGTTACAAGGAGCAGATATAAATACATCCGAGGATCCACTATATGCACTTAATAGTATAAGGACCAGTAATGTAAAAACTTTGAGTATAATTGAAGGAAACTTAGTTTCAGTGTCACCAGATATTTACAAACTGAGTATGTTAGAGGAACTCATTATCGTTAACAATATGGTTGAAAAATTAAACCTCGCCAAATTAGTCTTCATGTCTTCTCTGACTACACTCAATATGTCTAGAAATTTAATTTCAACAATCGAAAGCGTCGACTTTCAAATAGAAGCGAGCGGCGGGATTCATACTGTTGACTTGAGTTATAATCAACTGGAGACAATACCAGATAATTGTTTTTTAAAATTCCCCCGACTACTTTATCTCGATCTGTCTCATAATTCGATAAAGAAAATCGAGTTGCTCACGTTTGAAGGTATGAGAAGCATCGAAACACTGTTGCTCTCTTACAATGAAATAAAAAATATGGGCTTAAATTTTGTAAGGTTCATAAATTTGAAAAAACTGGAACTGGATCACAACGAACTGACGTCGTTAAGTGAAGAAAGCGTGAAGAATTTAATAAACTTGGAACACTTGAATCTCAGCTCGAATCAGTTAAGAACAATACAAGAAAATAGTTTTAGAGGGCTACAAAAATTACAGGAAATAGATTTGTCAAATAATCAAATCAAGACTGTTCAAGCACATCTGTTTCAAAGTAATATCAATCTGCACACAGTTTACTTTTCGAACAATTACATTGAAAATATACAGGATGGTGCTTTTGATGGAACTAATATAACAGAATTATCCATAAAAGGTAATTGCATCGTTGGAACTATAAATTCTAATACGTTTCTTGGAGTTCATGTCGACAGTATAGATTTGTCTGGCGGAAAGATAACGACTATTGGTGATGAAGCATTCAGTAATGTGGGAGGCGAATTGACTAGTTTGAATTTAAGCAGAAATAGCATAGAAATTATGGCAAAGTCGTGCTTCAAAAATTTGACCGCATTGTCCAAGTTGGATCTATCCAATAATGATTTAGTTGAAATAGATTTTGATAGTAGAGATTTAAAGATGTTGGAAGAGTTGTATTTGAAACAGAATAAAATTAAAAAAGTTCATAACATCGTATTTAGGGACCTAGAATCATTATTAACTTTAGACCTCTCTGAAAATGCTGTTCAGGAATTACAAGAAAACTATTTTGAAGGACTCAAAAACTTGGAAACACTTCTTCTTAATAATAACGAATTACATTTCTTAGCACCAAATGTGTTCAAAGGTTTGGAGAACCTCAATAAGTTAGACATGTCTCAAACAAGAATTATGTCCATCAATAATTTACTATTTGAAGGTTTAGTTTCCTTGGAAATATTAAACATTTCTCGAAGCCAGCTAAAAACAATCGAATTCGGAGCTTTTGATGGAACGAGTTGGATTAAAATTCTCGATGTGTCCTATAATGAATTAGAAAATTTTACTGTGAGTACTATTAAGTTGTCGCGATTAACACAATTATATTTAAATCACAATCGTTTGAAAAATATAACTGAAACAACACTTTCTAATATGACTTCTCTAGAAAAAATAAATTTATCTCATAATAACATTTCTCACATCCATTCCCTCGCTTTTCGTGCCATGGGTCATTTAAATTTTGTAGACCTCAATTTCAATATAGATATGGAAATACCGGGAGAGGTTTTTAATAACTTGCATATCTCAGAAGTATCCTTAGCGAATATTAAACGCCCTTTCAACTTCAGTCAAGCTAACAACGTCTCTATAACAACTTTAATCCTTTCAGAATGTAATATTTCCGATATAGATTCTCTATTTGTTTATAATATTGATAATTTACAAAAAATATTATTACAATCTAATTTAATAACATCACTCACTAAAGAGTCCTTTAAAAGAATGCCGCTTCTTAATTCACTTGAATTGAGTCGAAATAGAATATCTTTTATACAACCGGGAACATTTCTTCTCGCTGATATGATCAACACGCTTTACCTTAACGATAACGATTTGCGAGCTTTGCAATTTGGCTCACTTGATGGCCTTAAAAATCTTCGTTTCCTTAATTTGTCTAGCAATGCAATTAGGGAATTTAATCCGAAGCTTTTACGTGGCTTGCCCCATATATCAATTTTATACCTTGAAAATAACGGTATCGTTAAAATCGATTTCAAAGAGTTCGCTGAAACAAGCCTAAGAACTTTATACGTTGGACAAAATCCTTTGGCATGTGACCAGCTCACAAGGTTAAATATAACACAGTATGAAAACCTGGTTGTCACGGTTGGCCAATTGGATTTTCATTCAGAAAATATTGATGGGATCCCCTGTATAACATATTCTACATCAACAAAAGACCAAACAAATAATGCTGGAAACGAGGTGACGGACAAACTGACCGACTTGAAAGTGACCTTCAGCCTACTGCAAGACATATTCAGTAAAAATTTGAACGAAACGACGTCTATATCACAGAGTCTTAAAGATATTTTGACTCATATATCGAATTATAAAAATGAAATAATAACAGCACATAATAACTCCGAAAGATCATTATCATATTATCTACGAGAATTGCTAAATAGACAAGACTCGCTAAGAACAGTCCTGGTCAATTCAAATATTAACATAACAGAAGCTATTGGGAAGATTTTAATACAGTTCAATAACAACTTATCTAACTGGACCAAGAATTTTTCAAACGAAAACATCGAAGCTATGAAGATGTGGTCTTACAACAACGACAAGCAAACACAGCTATCAACACACCCATACACTGAACAATCGTATGAAAACAATGTTAAAGATTCTGATAATTATCTTCTACAACTGGGACTCAAAATGAGACTAGCCACCCATTGCGATTATCGCATACAATGCATTAACAATTTGAACCATATAAACTTGGAAAAGGAATGCGGCGGTTCAAGTAACTATGACGTCACCATCGCTTTGACTCTCCACAACGCTACGGATTCGTTTCAAACCGAGAGCGACCCCAGCATTTTACAAGCAATTACTACTCTCACGGTATTTGGAAACTGGCCCCAAACTAAACTTTCATTTCTGGAACACATGTACAGATTAAAGAATTTAAATGTCATTTATAGCAATATACAAATAGTTGAAGATAATCCTCTGAACCACCTCTTCAATCTGGAGAGTGTAGATTTTTCACATAACGGTTTAACAGATGTCGGAGAAATTTTTGTATTTGAAAAGCGGCCATTTAAATTGCATAAAATATCACTCTCATATAATGCAATCGTCGAGATCCCGGGCTATACTTTTGAAGATGTGACAAGTCTGATTGAGCTGGATCTTTCTCATAATATGATTGAAAACCTGAATGACAAGCCATTCACTAATTTGACCAATTTAGAAATACTCAAACTAGACCACAACAGAATCAAGAACTTGCAAGGCGCCATGAATGAGTTGTTTAATCTTAAGCATTTGTATCTTAGATACAATGAGTTAAATAATATTGATCTCGAATCCTTGAAAACTATTAATCACTTAAAGACATTCGATATATCTGTCAATCATTTGGAAGAATTGAACGATGCAATTTTCCTACGCCACTGGGAGCACTTCAATGGTTATTTTATATGTAAAATTAATCTATCAAAGAATAGATTAACTTACATACCGAACGCCATGATACTTGACGCTGGACACGAAACGCATACTAAGAAATCAGTTGCGACTGAACTTGATTTATCAGGCAACACTATCACCGACATTGATTTCAATGCCTTTCAATCTATAGAACACCTTATATCTTTGGACGTGTCAGACAATAAACTAATGACTTTTGACGTAAATCCTGAAAATTTGAGCAGTGTTAAATATCTTAATTTGAGCTGTAATTTTCTTAGAACATTACAGTATAGGAGTTTTTCTTTGATGCGTAACTTAGAAAATTTGGATGTGTCGCACAATTTGTTAGAATACTTTCCAGATCAATCTCTTATCAACACTCACCAACTGAGACACATCAACGTGACTATGAATGATATAGTTGACCTCCACAATTTGAGAATAACATTTCATCCGGCTGGAGGGGTTTTGGATATGTCTAATAACAGTTTGTCCGTCCTAAGGATCCCAGTTAACGAAGCAGTGGGTTTGACTGAACTGATATTGAAATCAAACAACATAACTGATGCATATCTAATACAATTGAAGGATGCCCCAAATTTGGTACGTCTAGACATGAGTAGGAACATTATATCAGACTTAGACGAGTCTTCGTTACAGTTACCAGAGACATTGGTATATATAGATTTGAATTTTAATGATATTCAAAGAATTGGACCCTCATCATTTTATCGCGTGCCCAATCTAAAAACTTTAAGATTATCCCACAACCGAATACAAAATTTACAATACGGTTCCTTCAGCGGTTTATCAAATCTTCTAAATTTAGATCTTTCACATAACCAAATCGGATATTTGGATTCAAAGTTGCTTATGGATCTGAAGTTCCTAACTATACTTTCATTGCGTTATAATAATATGCACAGCCTTAATGATGACAGTTGGATACATCATAAACAGGAGCTGAAGATATATTTGGATGGTAATGATTTATCTTGTAATTGGTTGGCCAAGACTCTGAACAATTACAATAATGGTTACTCCAAAGTACAGCCTAAGGTACTCCAGCCTGTGGTTGAAGGTAATTCTATAGAGGGAATCCCATGCACACAGGAGGTGGAAAATACGGAAATTGATCAGAAATACGTTATAGATGAAAGACTATTGAAGGCTGTCCAAAAAATATTAGAAGCGGTACAGAATCAAACATTGTATTTAAAGAAAATCAATTGGTTATCAATTTTGCAAAACGCAAGAAACAACATGGCGTCAAATGCAAACGAACCGTGA

Protein sequence:

>DPOGS202901-PA
MMFLHFMIILLAALPCICGECHFIPLPKLEKCRAALNCSITLTNPSSNLDSWTCIRKQKVNYDYYYRNNYDNSYTLDTNYELYITLQGADINTSEDPLYALNSIRTSNVKTLSIIEGNLVSVSPDIYKLSMLEELIIVNNMVEKLNLAKLVFMSSLTTLNMSRNLISTIESVDFQIEASGGIHTVDLSYNQLETIPDNCFLKFPRLLYLDLSHNSIKKIELLTFEGMRSIETLLLSYNEIKNMGLNFVRFINLKKLELDHNELTSLSEESVKNLINLEHLNLSSNQLRTIQENSFRGLQKLQEIDLSNNQIKTVQAHLFQSNINLHTVYFSNNYIENIQDGAFDGTNITELSIKGNCIVGTINSNTFLGVHVDSIDLSGGKITTIGDEAFSNVGGELTSLNLSRNSIEIMAKSCFKNLTALSKLDLSNNDLVEIDFDSRDLKMLEELYLKQNKIKKVHNIVFRDLESLLTLDLSENAVQELQENYFEGLKNLETLLLNNNELHFLAPNVFKGLENLNKLDMSQTRIMSINNLLFEGLVSLEILNISRSQLKTIEFGAFDGTSWIKILDVSYNELENFTVSTIKLSRLTQLYLNHNRLKNITETTLSNMTSLEKINLSHNNISHIHSLAFRAMGHLNFVDLNFNIDMEIPGEVFNNLHISEVSLANIKRPFNFSQANNVSITTLILSECNISDIDSLFVYNIDNLQKILLQSNLITSLTKESFKRMPLLNSLELSRNRISFIQPGTFLLADMINTLYLNDNDLRALQFGSLDGLKNLRFLNLSSNAIREFNPKLLRGLPHISILYLENNGIVKIDFKEFAETSLRTLYVGQNPLACDQLTRLNITQYENLVVTVGQLDFHSENIDGIPCITYSTSTKDQTNNAGNEVTDKLTDLKVTFSLLQDIFSKNLNETTSISQSLKDILTHISNYKNEIITAHNNSERSLSYYLRELLNRQDSLRTVLVNSNINITEAIGKILIQFNNNLSNWTKNFSNENIEAMKMWSYNNDKQTQLSTHPYTEQSYENNVKDSDNYLLQLGLKMRLATHCDYRIQCINNLNHINLEKECGGSSNYDVTIALTLHNATDSFQTESDPSILQAITTLTVFGNWPQTKLSFLEHMYRLKNLNVIYSNIQIVEDNPLNHLFNLESVDFSHNGLTDVGEIFVFEKRPFKLHKISLSYNAIVEIPGYTFEDVTSLIELDLSHNMIENLNDKPFTNLTNLEILKLDHNRIKNLQGAMNELFNLKHLYLRYNELNNIDLESLKTINHLKTFDISVNHLEELNDAIFLRHWEHFNGYFICKINLSKNRLTYIPNAMILDAGHETHTKKSVATELDLSGNTITDIDFNAFQSIEHLISLDVSDNKLMTFDVNPENLSSVKYLNLSCNFLRTLQYRSFSLMRNLENLDVSHNLLEYFPDQSLINTHQLRHINVTMNDIVDLHNLRITFHPAGGVLDMSNNSLSVLRIPVNEAVGLTELILKSNNITDAYLIQLKDAPNLVRLDMSRNIISDLDESSLQLPETLVYIDLNFNDIQRIGPSSFYRVPNLKTLRLSHNRIQNLQYGSFSGLSNLLNLDLSHNQIGYLDSKLLMDLKFLTILSLRYNNMHSLNDDSWIHHKQELKIYLDGNDLSCNWLAKTLNNYNNGYSKVQPKVLQPVVEGNSIEGIPCTQEVENTEIDQKYVIDERLLKAVQKILEAVQNQTLYLKKINWLSILQNARNNMASNANEP-